Zu Beginn eines neuen Schuljahres an der Sainotama-Mädchenschule werden drei Kindheitsfreundinnen wiedervereint, nachdem sie verschiedene Mittelschulen besucht haben. Die energiegeladene und impulsive Nozomu Tanaka, die berüchtigt schlecht in schulischen Leistungen und im Lesen sozialer Signale ist, beschließt, die Zeit damit zu verbringen, jedem in ihrer Klasse einen Spitznamen basierend auf dessen markantestem Merkmal zu geben. Ihre vernünftige Otaku-Freundin Akane Kikuchi wird Wota genannt, eine Anspielung auf ihre Besessenheit mit Manga und Yaoi. Ihre andere Begleiterin, die stoische und hochintelligente Shiori Saginomiya, wird Robo genannt, aufgrund ihrer emotionslosen, mechanischen Art. Als Vergeltung für ihre Streiche erhält Tanaka selbst den Spitznamen Baka, was Idiot bedeutet, und er bleibt sofort haften.

Die Realserie folgt den täglichen, oft sinnlosen Gesprächen und Abenteuern dieser drei Mädchen zusammen mit ihren einzigartig exzentrischen Klassenkameradinnen. Die Hauptgeschichte folgt keiner großen Erzählung, sondern konzentriert sich auf den Humor der verschwendeten Jugend und erkundet die Eigenheiten jeder Figur, während sie das Schulleben meistern. Zu ihren Freundinnen gehört Saku Momoi, genannt Loli, die wie ein Kind aussieht und es zutiefst hasst, wie eines behandelt zu werden. Minami Yamamoto, bekannt als Yamai, ist eine Chunibyo, die eine Augenklappe trägt und glaubt, eine Halbblut-Kriegerin zu sein, die gegen eine geheime Organisation kämpft. Die schüchterne, aber mathematisch brillante Kanade Ninomae, mit dem Spitznamen Majime für ihre ernste Art, ist heimlich ein jungenhaft aussehendes Mädchen, das sich ihrer eigenen Beliebtheit nicht bewusst ist. Die Klasse umfasst auch die okkultbesessene Einsiedlerin Hisui Kujyo, genannt Majo, und die schöne halb-österreichische Transferstudentin Lily Someya, die behauptet, eine Allergie gegen Männer zu haben, aber ein verwirrendes Interesse an Baka zeigt. Ihr lang leidender Klassenlehrer, Masataka Sawatari oder Waseda, ist ein junger Mann mit einem geheimen Leben als Vocaloid-Musikproduzent, sehr zur verborgenen Bewunderung von Wota.

Größere Handlungsbögen drehen sich typischerweise um die Folgen von Bakas gedankenlosen, aber oft gut gemeinten Plänen, wie ihre desaströsen Versuche, einen Freund zu finden, oder ihre brutale Ehrlichkeit, die irgendwie einem kämpfenden Ramen-Ladenbesitzer und seiner Tochter hilft. Der Bogen um Lily konzentriert sich auf ihre seltsame allergische Reaktion auf Baka und ihre zunehmend intensiven Versuche, ihr näher zu kommen, sehr zur Verwirrung des Restes der Klasse. Ein weiterer bedeutender Bogen erkundet die Freundschaft zwischen Majime und Robo, während Majime verzweifelt versucht, einen Weg zu finden, mit jemandem in Kontakt zu treten, den sie als intellektuell gleichwertig betrachtet. Die Serie baut auf Momente echter Freundschaft hin, die darin gipfeln, dass die Klasse zusammenkommt, um zu verhindern, dass Baka aufgrund ihrer schlechten Noten ein Jahr wiederholen muss. Der Ton bleibt eine temporeiche, charaktergetriebene Komödie, die die ziellosen und absurden Momente feiert, die das Schulleben definieren.