"Onegai Twins" ist eine 12-teilige Anime-Serie, die als Spin-off der Serie "Onegai Teacher" fungiert, jedoch eine eigenständige Handlung besitzt. Die Geschichte spielt in der fiktiven Stadt Kannami und dreht sich um den Protagonisten Maiku Kamishiro, einen Studenten, der allein in einem verlassenen Gebäude lebt, das er als sein Zuhause bezeichnet. Eines Tages tauchen zwei Mädchen, Miina Miyafuji und Karen Onodera, in seinem Leben auf, die beide behaupten, seine leibliche Schwester zu sein. Beide haben keine Erinnerungen an ihre frühere Kindheit, abgesehen von einem Foto, das sie mit Maiku als kleines Kind zeigt.

Miina ist eine lebhafte und energische Person, die oft impulsiv handelt, während Karen ruhig und zurückhaltend ist, aber eine starke Entschlossenheit besitzt. Die beiden Mädchen ziehen bei Maiku ein, und die Serie folgt ihrem Zusammenleben, während sie versuchen, die Wahrheit über ihre familiären Bindungen herauszufinden. Die Handlung konzentriert sich auf die Beziehungen zwischen den drei Hauptfiguren, ihre alltäglichen Interaktionen und die emotionalen Herausforderungen, die sich aus ihrer ungewissen familiären Situation ergeben.

Im Laufe der Serie werden verschiedene Hinweise und Rückblenden eingeführt, die die Vergangenheit der Charaktere beleuchten. Dabei wird die Frage, wer von den beiden Mädchen tatsächlich Maikus Schwester ist, immer wieder in den Mittelpunkt gerückt. Die Handlung entwickelt sich durch eine Mischung aus humorvollen, romantischen und dramatischen Momenten, wobei die Beziehungen zwischen den Charakteren im Vordergrund stehen. Die Serie endet mit einer Auflösung des Rätsels um die familiären Bindungen, die sowohl überraschend als auch emotional befriedigend ist.

Neben den Hauptfiguren gibt es weitere Nebencharaktere, die das Geschehen beeinflussen, darunter Maikus Freunde und Kommilitonen, die oft für komödiantische oder unterstützende Momente sorgen. Die Serie behandelt Themen wie Identität, Familie und die Bedeutung von Erinnerungen, während sie die emotionalen Verbindungen zwischen den Charakteren erforscht.