"Kannagi" ist eine Anime-Serie, die auf dem gleichnamigen Manga von Eri Takenashi basiert. Die Handlung dreht sich um Jin Mikuriya, einen Schüler, der in einer ländlichen Gegend lebt. Eines Tages beschließt er, einen Baum zu fällen, der auf dem Gelände seiner Schule steht, um daraus eine Holzskulptur zu schnitzen. Als er den Baum fällt, erscheint plötzlich ein Mädchen namens Nagi, das behauptet, eine Gottheit zu sein. Sie erklärt, dass der Baum ein heiliger Ort war, der sie beherbergte, und dass sie durch das Fällen des Baumes ihrer physischen Form beraubt wurde. Ohne den Baum ist Nagi gezwungen, in der menschlichen Welt zu bleiben, und Jin bietet ihr an, bei ihm zu wohnen.

Nagi, die sich als temperamentvoll und egozentrisch erweist, versucht, ihre Kräfte als Gottheit wiederzuerlangen, während sie sich an das Leben in der menschlichen Welt anpasst. Sie entwickelt eine enge Beziehung zu Jin, obwohl ihre Persönlichkeiten oft aufeinanderprallen. Im Laufe der Serie wird deutlich, dass Nagis Anwesenheit in der menschlichen Welt nicht ohne Konsequenzen bleibt. Unreinheiten, die als "Unreinheiten" bezeichnet werden, beginnen sich zu manifestieren und bedrohen die Umgebung. Nagi und Jin arbeiten zusammen, um diese Unreinheiten zu beseitigen, wobei Nagi ihre göttlichen Kräfte einsetzt, während Jin sie unterstützt.

Weitere Charaktere spielen eine wichtige Rolle in der Handlung. Dazu gehört Tsugumi Aoba, eine Klassenkameradin von Jin, die heimlich in ihn verliebt ist und sich oft eifersüchtig auf Nagi zeigt. Zusätzlich gibt es Zange, eine weitere Gottheit, die Nagi kennt und oft als Kontrast zu ihrer impulsiven Art dient. Zange ist ruhig und berechnend und bietet oft Ratschläge oder Hilfe, wenn Nagi und Jin in Schwierigkeiten geraten.

Die Serie verbindet Elemente von Comedy, Slice of Life und übernatürlichen Themen. Die Dynamik zwischen den Charakteren, insbesondere zwischen Jin und Nagi, steht im Mittelpunkt, während die übernatürlichen Konflikte als Rahmen für ihre Entwicklung dienen. Die Handlung erkundet Themen wie Identität, Verantwortung und die Beziehung zwischen Mensch und Gottheit, ohne dabei den humorvollen und oft absurden Tonfall zu verlieren.