Joe Shimamura, mit der Bezeichnung Cyborg 009, ist der zentrale Protagonist der Cyborg-009-Erzählung. Er ist ein junger Mann von durchschnittlicher Größe mit schlanker Statur, der typischerweise etwa achtzehn Jahre alt zu sein scheint. Sein markantestes körperliches Merkmal ist sein dunkles, zerzaustes Haar mit einer markanten Strähne, die stets eines seiner Augen bedeckt, während das andere sichtbar bleibt. Seine Herkunft ist ein wichtiger Aspekt seiner Identität, da er durchgängig als gemischter japanischer und ausländischer Abstammung dargestellt wird. Im zivilen Leben wurde er mit unterschiedlichen Hintergründen gezeigt, von einem kriminellen Jugendlichen bis hin zu einem berühmten Rennfahrer namens Hurricane Joe, wobei der gemeinsame Nenner seine letztendliche Gefangennahme durch die böswillige Organisation Black Ghost ist. Nachdem er entführt und zwangsweise in einen Cyborg verwandelt wurde, erhielt er die Bezeichnung 009, das letzte und fortschrittlichste Modell der 00-Cyborg-Reihe.

Joe zeichnet sich durch eine kraftvolle und idealistische Persönlichkeit aus. Als jüngstes Mitglied des Cyborg-Teams ist er im Kern zutiefst mitfühlend und heldenhaft. Nachdem er immense persönliche Tragödien erlebt hat, darunter die Verwaistheit und die falsche Beschuldigung, den Priester ermordet zu haben, der ihn aufgezogen hat, entwickelt er ein tiefes Einfühlungsvermögen für andere, die gelitten haben. Dieses Einfühlungsvermögen erstreckt sich sogar auf seine Feinde; er glaubt aufrichtig an die Möglichkeit der Erlösung und verabscheut das Töten zutiefst, wobei er oft versucht, mit Gegnern zu verhandeln, anstatt sie zu vernichten. Dieser Idealismus wird durch einen starken Hang zur Selbstaufopferung ausgeglichen. Er fühlt ein starkes Verantwortungsgefühl als Beschützer der Menschheit, was dazu führen kann, dass er Lasten allein auf sich nimmt, was bei seinen Teamkollegen Besorgnis auslöst. Seine Motivationen sind klar und persönlich. Während er sich der Niederlage von Black Ghost für das Leid, das sie ihm und anderen zugefügt haben, widmet, ist sein Hauptantrieb, unschuldige Menschen zu beschützen und zu verhindern, dass die Tragödien, die er erlitten hat, jemand anderem widerfahren.

Innerhalb der Geschichte fungiert Joe als Feldkommandant der 00-Cyborgs, eine Position, die er natürlicherweise einnimmt, wenn die Gruppe als Team agiert. Seine Rolle ist nicht nur die eines Kriegers, sondern auch das Herz der Gruppe, das oft als moralischer Kompass dient. Seine wichtigsten Beziehungen sind zentral für seine Entwicklung. Er verbindet sich tief mit seinen Mit-Cyborgs, die für ihn zu einer Ersatzfamilie werden, einem Schatz, den er über alles schätzt. Er teilt eine besonders enge und beständige romantische Verbindung mit Françoise Arnoul, Cyborg 003, eine Beziehung, die ihm emotionale Stabilität verleiht und eine Quelle tiefer persönlicher Motivation ist. Zusammen mit den anderen Cyborgs wird er von ihrem Schöpfer, Dr. Gilmore, geführt, der dem Team hilft, Black Ghost zu entkommen und eine Kraft für das Gute zu werden. Im Laufe der Zeit entwickelt sich Joe von einem zweifelnden und traumatisierten jungen Mann zu einem selbstbewussten und fähigen Helden. Er stellt sich den schmerzhaften Ereignissen seiner Vergangenheit, einschließlich des Geheimnisses seiner Geburt und des Todes seines Ziehvaters, und findet Abschluss, indem er lernt, dass seine neue Familie seine größte Stärke ist. Er kämpft mit der Last seiner Pflichten und dem Wunsch nach einem normalen Leben, tritt aber konsequent vor, um sich neuen Bedrohungen zu stellen, wenn die Menschheit ihn braucht.

Joe besitzt eine beeindruckende Reihe von Fähigkeiten, die ihn zum mächtigsten der 00-Cyborgs machen. Sein kybernetischer Körper wurde unter Verwendung der besten Elemente seiner Vorgänger entworfen und verleiht ihm übermenschliche Stärke, eine als Eisenhaut beschriebene Widerstandsfähigkeit und die Fähigkeit, extreme Bedingungen zu überleben. Seine charakteristischste und ikonischste Fähigkeit ist der Beschleunigungsmodus. Aktiviert durch das Drücken eines Schalters, der in einem seiner Backenzähne eingebaut ist, ermöglicht ihm diese Fähigkeit, sich mit unglaublichen Geschwindigkeiten zu bewegen, in vielen Versionen bis zu Mach 5, sodass alles um ihn herum wie eingefroren erscheint. In einigen Iterationen kann diese Kraft noch extremere Ausmaße annehmen, die es ihm erlauben, sich schneller als das Licht zu bewegen und sogar die Zeit zu verzerren. Es gibt eine entscheidende Einschränkung dieser Kraft; das Berühren eines normalen Menschen im Beschleunigungsmodus würde diesen aufgrund der enormen Kräfte und Reibung schwer verletzen oder töten. Er ist außerdem mit einer multifunktionalen Superpistole ausgestattet, verfügt über verbesserte sensorische Fähigkeiten und kann über ein internes Funksystem mit seinen Teamkollegen kommunizieren.