Joe Shimamura, der als Cyborg 009 bezeichnet wird, war ursprünglich ein halbjapanisches Waisenkind, das nach dem frühen Tod seiner Mutter von einem katholischen Priester aufgezogen wurde. Seine frühen Jahre waren geprägt von Einsamkeit und Mobbing aufgrund seiner gemischten Herkunft, obwohl er unter anderen Waisenkindern Freundschaft fand. Diese Jugendphase nahm eine dunklere Wendung, als der Priester, der heimlich mit einer finsteren Organisation namens Black Ghost verbunden war, ermordet wurde, während er versuchte, deren Machenschaften aufzudecken. Joe wurde fälschlicherweise für den Tod und den anschließenden Brand der Kirche verantwortlich gemacht, was zu seiner Verhaftung führte. Bei einem Fluchtversuch aus Polizeigewahrsam wurde er von Black-Ghost-Agenten gefangen genommen und zwangsweise zum fortschrittlichsten ihrer 00-Cyborgs umgewandelt, mit der Bezeichnung Nummer 009.

Als Person wird Joe von seinem tief verwurzelten Mitgefühl und Idealismus definiert, was einen starken Kontrast zu den gewalttätigen Umständen seiner Erschaffung bildet. Er ist eine heldenhafte Figur, die das Töten zutiefst verabscheut und fest an das Potenzial zur Erlösung glaubt, selbst für seine Feinde. Diese moralische Überzeugung wird von einer starken selbstaufopfernden Natur angetrieben, die aus dem Verlust aller geliebten Menschen in seiner Kindheit erwächst. Oft verspürt er ein starkes Verantwortungsgefühl, andere zu beschützen, was ihn manchmal dazu bringt, Lasten alleine tragen zu wollen. Dies führt unbeabsichtigt zu Spannungen mit seinen Teammitgliedern, wenn sein Fokus auf Fremde oder eine Mission deren emotionale Bedürfnisse zu vernachlässigen scheint. Seine Motivation ist zweifach: Black Ghost zu zerschlagen und deren Förderung globaler Kriegsführung zu beenden, sowie seine neu gefundene Familie zu beschützen, da er seine Mit-Cyborgs nicht nur als Verbündete, sondern als seine wahre Familie betrachtet.

Innerhalb des Teams fungiert Joe als Feldanführer und ist dessen mächtigstes Mitglied. Seine Rolle ist zentral für ihre Kämpfe, oft ist er der entscheidende Faktor gegen gefährliche Gegner. Seine wichtigsten Beziehungen bestehen zu den anderen Cyborgs und ihrem Schöpfer, Dr. Gilmore. Eine besonders enge Bindung teilt er mit Ivan Whisky, Cyborg 001, dessen telepathische Führung ihm half, der Gefangenschaft zu entkommen und sein Potenzial zu entfalten. In mehreren Adaptionen wird eine sich entwickelnde romantische Beziehung mit Françoise Arnoul, Cyborg 003, dargestellt, geprägt von gegenseitiger, oft unausgesprochener Zuneigung. In verschiedenen Handlungssträngen, einschließlich des Yomi-Bogens und der Ereignisse von God's War, durchläuft Joe bedeutende Entwicklung. Er wandelt sich von einem verwirrten, wütenden Amnesiepatienten, der nach Antworten über seine Vergangenheit sucht, zu einem entschlossenen und mitfühlenden Anführer, der seine Rolle als Beschützer der Menschheit annimmt, während er an seinem idealistischen Glauben an Erlösung festhält.

Als Höhepunkt der Black-Ghost-Technologie verfügt Joe über eine beeindruckende Reihe von Fähigkeiten. Er besitzt übermenschliche Stärke, eine Widerstandsfähigkeit, die seine Haut nahezu undurchdringlich macht, gesteigerte Beweglichkeit und mechanische Lungen, die ihm das Atmen unter Wasser ermöglichen. Seine charakteristischste und mächtigste Fähigkeit ist jedoch der Beschleunigungsmodus. Aktiviert durch einen Schalter in einem seiner Backenzähne, erlaubt ihm diese Kraft, sich mit übermenschlicher Geschwindigkeit bis zu Mach 5 zu bewegen, wodurch die Welt um ihn herum wie eingefroren erscheint. Diese Fähigkeit ist nicht ohne Risiko; die extreme Luftreibung kann unbelebte Objekte entzünden, und physischer Kontakt mit einer nicht-cyborg Person während der Beschleunigung führt zu schweren Verletzungen oder Tod. In einigen späteren Kontinuitäten werden seine Kräfte weiter verstärkt, um ihm Teleportation und die Fähigkeit zu verleihen, Moleküle von Objekten bei Berührung zu beschleunigen und sie so explodieren zu lassen.