Marco Nogata ist eine Nebenfigur in FLCL Progressive. Er ist ein Mittelschüler in Hidomi Hibajiris Klasse und eng mit Goro und Ko Ide befreundet. Während eines Großteils der Geschichte bleibt Marco im Hintergrund, als Teil des alltäglichen Schulgeschehens. Seine Rolle wird aktiver, als er Ide zum Strand begleitet, wo sie ein schüchternes Mädchen namens Aiko treffen. Marco entdeckt später, dass Goro Aiko für ihre Gesellschaft bezahlt hat, und als Goro ihm Aikos Topfpflanze gibt, wird Marco kurzzeitig in die sich entfaltenden Ereignisse um die ungewöhnlichen Eigenschaften der Pflanze verwickelt. Er entwickelt auch ein kurzlebiges romantisches Interesse an Hidomi, nachdem ihre Kopfhörer eine plötzliche, fröhliche Persönlichkeitsveränderung verursachen; er findet ihre neue Art süß und überlegt, ihr ein Geschenk zu kaufen. Um Geld für diesen Zweck zu verdienen, nimmt er einen Job im Ohzu-Vergnügungspark an, eingestellt von Tonkichi. Marco zeichnet sich durch seine Loyalität gegenüber seinen Freunden und seine Bereitschaft aus, aus seiner gewohnten Routine auszubrechen, wenn etwas seine Aufmerksamkeit erregt, obwohl er nie zu einer zentralen Figur im größeren Konflikt wird. Er zeigt keine besonderen Fähigkeiten und bleibt ein gewöhnlicher Teenager, der in die außergewöhnlichen Umstände um ihn herum gerät.