Dr. Emmanuel Klipse ist der zentrale Antagonist der Monsuno-Serie. Ursprünglich war er ein Wissenschaftler, der gemeinsam mit Jeredy Suno und Jon Ace an der Erforschung der Kreaturen namens Monsuno arbeitete. Nachdem er sich von seinen Kollegen losgesagt hatte, gründete er die Organisation Eklipse mit dem Ziel, die Macht der Monsuno zur Erlangung der Weltherrschaft zu nutzen. Klipse ist ein Größenwahnsinniger, getrieben von einem übersteigerten Selbstwertgefühl. Er hält sich selbst für einen Propheten seiner eigenen Größe und ist völlig von der Überlegenheit seiner Ideen überzeugt. Er ist rücksichtslos und bereit, jedes noch so unethische Mittel einzusetzen, um seine Ziele zu erreichen. Seine Hauptmotivation ist die Erlangung absoluter Macht und Anerkennung.

Im Laufe der Serie dient Klipse als Hauptgegner und stellt sich in jeder Staffel dem Team Core‑Tech entgegen. Er führt Eklipse und später den Eklipse-Widerstand. Zu seinen wichtigsten Beziehungen gehören seine ehemaligen Kollegen, die zu seinen Feinden geworden sind, sowie Six, ein von ihm erschaffener Klon. Klipse kommandiert mehrere Monsunos, vor allem Backslash, seinen primären Partner, sowie Odon, Acro und ehemals Toxic Ace. Er leitet auch die Produktion aggressiver Monsunos durch seine Organisation und überwacht deren illegale Aktivitäten. In Bezug auf seine Entwicklung bleibt Klipse ein beständiger Widersacher; er bessert sich nie und wird in seinen Methoden nur extremer, indem er sich durch die Entwicklung neuer Technologien oder das Eingehen temporärer Allianzen anpasst. Zu seinen bemerkenswerten Fähigkeiten gehören ein hohes Maß an wissenschaftlichem Verstand, insbesondere in Bezug auf Monsuno-Essenz und Biotechnologie, strategische Führung eines großen kriminellen Netzwerks und effektive Kampfkontrolle über seine Monsunos, insbesondere Backslash.