Kyōtarō Kakei ist der Hauptprotagonist von A Good Librarian Like a Good Shepherd. Er ist ein fleißiger und zurückhaltender Schüler im zweiten Jahr der Shiomi-Akademie, einer renommierten Einrichtung, die für ihre riesige Bibliothek bekannt ist. Kakeis größte Leidenschaft ist das Lesen, und er verbringt fast seine gesamte Freizeit mit Büchern, sodass er sogar sein Zimmer im Wohnheim vollständig damit füllt. Er ist das einzige Mitglied des Schulbibliotheksclubs, eine Position, die er schätzt, weil sie ihm erlaubt, in Ruhe zu lesen, ohne mehr als nötig mit anderen zu interagieren.

Kakei wirkt wie ein ruhiger, aufmerksamer junger Mann, der die Einsamkeit bevorzugt und unnötige soziale Kontakte vermeidet. Er ist akademisch hervorragend und seit seinen frühen Schuljahren ein Ehrenschüler, auch wenn er diesen Status als gewöhnlich und uninteressant empfindet. Seine Entscheidung, sich an der Shiomi-Akademie einzuschreiben, war von seinem Wunsch getrieben, Zugang zu ihrer großen Bibliothek und den angeblich versteckten magischen Regalen darin zu erhalten. Trotz seiner introvertierten Art ist er im Grunde gutherzig und besitzt ein starkes Verantwortungsbewusstsein. Er neigt dazu, pragmatisch zu sein und wirkt manchmal wie ein Spielverderber, wenn der Club Freizeitaktivitäten vorschlägt, aber er öffnet sich allmählich für die Freude an gemeinsamen Erlebnissen.

Seine Motivationen wurzeln in einem Kindheitstraum: Er wünschte sich, alle magischen Bücher der Welt zu lesen, die in einer magischen Bibliothek aufbewahrt wurden. Um Zugang zu dieser Bibliothek zu erhalten, erhielt er von einer als der Hirte bekannten Figur ein Lesezeichen, das als Eintrittskarte diente. Die Bedingung für die Nutzung des Lesezeichens ist, dass er Freundlichkeit zeigen und den Menschen, denen er begegnet, Glück bringen muss. Dieses Versprechen treibt ihn dazu, anderen zu helfen, selbst wenn er sich zunächst gegen eine Beteiligung sträubt.

Die Geschichte beginnt, als Kakei eine mysteriöse Textnachricht vom Hirten erhält, die vorhersagt, dass sich sein Schicksal an diesem Tag ändern wird. Kurz darauf nutzt er seinen ausgeprägten sechsten Sinn, um eine Mitschülerin, Tsugumi Shirasaki, vor einer Straßenbahnentgleisung zu retten. Tsugumi tritt später dem Bibliotheksclub bei und schlägt das Shiomi-Happy-Projekt vor, eine Initiative, um die Akademie zu einem angenehmeren Ort zu machen. Kakei stimmt widerwillig zu zu helfen, und unter der Führung des Hirten treten weitere Schülerinnen dem Club bei: die wohlhabende und talentierte Tamamo Sakuraba, die berühmte Sängerin Senri Misono, die energiegeladene Athletin Kana Suzuki und die ruhige, aber aufmerksame Nagi Kodachi. Obwohl Kakei offiziell nicht der Clubpräsident ist, verlassen sich die anderen Mitglieder stets auf seinen Rat und seine Führung.

Kakeis Beziehungen zu diesen Mädchen bilden den emotionalen Kern der Erzählung. Seine Bindung zu Tsugumi ist besonders eng, da sie diejenige ist, die ihn aus seinem Schneckenhaus lockt und ermutigt, mit anderen zu interagieren. Die unterschiedlichen Persönlichkeiten der Clubmitglieder fordern seine einsame Natur heraus und mildern allmählich sein Auftreten. Im Laufe der Geschichte entwickelt sich Kakei von einem distanzierten Bücherwurm zu einem geselligeren und einfühlsameren Individuum, das sich aufrichtig um seine Freunde kümmert und Verantwortung für ihr Wohlbefinden übernimmt.

Was seine Fähigkeiten betrifft, besitzt Kakei einen einzigartigen sechsten Sinn, der es ihm erlaubt, bevorstehende Ereignisse wahrzunehmen oder Gefahren zu spüren, was er erstmals demonstriert, indem er den Straßenbahnunfall vorhersagt. Diese Intuition ist mit dem Lesezeichen des Hirten und der versteckten magischen Bibliothek verbunden. Aufgrund seiner umfangreichen Lektüre ist er auch in einer Vielzahl von Themen sehr bewandert, und er nutzt dieses Wissen oft, um die Probleme der Clubmitglieder zu lösen. Seine ruhige und analytische Art macht ihn zu einem effektiven Vermittler und Problemlöser, obwohl er bescheiden bleibt und keine Anerkennung sucht.