Van Hohenheim ist ein trügerisch alter und außergewöhnlich mächtiger Alchemist, der als entfremdeter Vater von Edward und Alphonse Elric dient. Seine Geschichte beginnt Jahrhunderte vor den Hauptereignissen der Geschichte im alten Königreich Xerxes, wo er als Analphabet und Sklave lebte, der nur unter der Nummer dreiundzwanzig bekannt war. Sein Leben änderte sich für immer, als ein Homunkulus, der in einer Flasche lebend, mit Hohenheims Blut erschaffen wurde. Als Geste der Dankbarkeit gab dieses Wesen dem Sklaven den Namen Hohenheim und lehrte ihn lesen, schreiben und Alchemie praktizieren. Der Homunkulus überzeugte später den König von Xerxes, unter dem Vorwand der Unsterblichkeit einen massiven Transmutationskreis durchzuführen. Als der Kreis aktiviert wurde, wurde jeder Bürger des Landes geopfert, um einen gewaltigen Stein der Weisen zu erschaffen. Der Homunkulus nahm die Hälfte dieser Seelen, um seinen eigenen Körper zu formen und wurde zu dem Wesen, das als Vater bekannt ist, während die andere Hälfte der Seelen in Hohenheims Körper gezwungen wurde und ihn in einen lebenden Stein der Weisen verwandelte. Obwohl er über fünfhunderttausend Seelen in sich trug, widmete Hohenheim Jahre dem Gespräch mit jeder einzelnen und half ihnen, ihren Wahnsinn und ihr Leid zu überwinden.

Was die Persönlichkeit betrifft, erscheint Hohenheim zunächst als kalte oder distanzierte Figur, was größtenteils auf seine Schwierigkeiten in der Kommunikation und die immense Last zurückzuführen ist, die er seit Jahrhunderten trägt. Er ist im Allgemeinen sanft, müde und leise, reagiert mit bemerkenswerter Ruhe, selbst als sein Sohn Edward ihm ins Gesicht schlägt. Er neigt zu dummen Aussagen, ist immun gegen Verlegenheit und spricht oft in kryptischer Weise, während er gelegentlich den Charakter derer testet, die ihm begegnen. Er besitzt ein mitfühlendes und pazifistisches Wesen, bleibt bescheiden und nimmt niemals Komplimente für sich selbst an. Sein langes Leben hat ihm eine Perspektive gegeben, die ihn manchmal distanziert erscheinen lässt, aber dies verbirgt eine tiefsitzende Schuld und einen echten Wunsch, andere zu beschützen. Ihm fehlt der obsessive Antrieb, der seinen Sohn Edward auszeichnet, und in seiner Jugend war er ein Mensch ohne Ehrgeiz, der mit einem einfachen Leben zufrieden gewesen wäre.

Hohenheims Hauptmotivation während der gesamten Geschichte ist es, Vaters Plan zu stoppen, die gesamte Nation Amestris als Opfer zu nutzen, um einen weiteren Stein der Weisen zu erschaffen und die Macht eines Gottes zu erlangen. Nachdem er diesen Plan entdeckt hatte, verließ er seine geliebte Familie in Resembool, im Verständnis, dass seine Söhne ihn für seine Abwesenheit hassen würden, aber dies als notwendig akzeptierend, um ihr Leben und das Leben aller im Land zu retten. Unter diesem heldenhaften Ziel verbirgt sich ein persönlicherer Wunsch. Nachdem er endlich wahre Liebe mit seiner Frau Trisha Elric gefunden hatte, wollte Hohenheim verzweifelt wieder sterblich werden, damit er gemeinsam mit seiner Familie alt werden und sterben konnte. Er verbrachte Jahre damit, nach einem Weg zu suchen, dies zu erreichen. Seine Liebe zu Trisha, die er als die einzige Frau betrachtete, die er je wirklich geliebt hatte, steht in starkem Kontrast zu seinen vorherigen Jahrhunderten zielloser Existenz.

Im weiteren Verlauf der Erzählung agiert Hohenheim für einen Großteil der Serie weitgehend im Hintergrund, aber seine Handlungen erweisen sich als entscheidend für das endgültige Ergebnis. Er verbrachte Jahre damit, durch Amestris zu reisen und heimlich Fragmente seines eigenen Steins der Weisen an Schlüsselpunkten im ganzen Land zu platzieren. Als Vater schließlich am Versprochenen Tag den landesweiten Transmutationskreis aktivierte, aktivierte Hohenheim seinen eigenen Gegenkreis, der die Wirkung umkehrte und die Seelen aller Bürger Amestris' in ihre Körper zurückführte, wodurch unzählige Leben gerettet wurden. Er stellte sich direkt Vater, um zu versuchen, die Angelegenheiten friedlich zu regeln, bevor Gewalt notwendig wurde, und schützte später Izumi Curtis und Edward vor einer tödlichen Explosion, indem er seinen eigenen Körper einsetzte. Schließlich bot er seinen eigenen Körper als Material an, damit Edward Alphonse vom Tor der Wahrheit zurückholen konnte.

Hohenheims wichtigste Beziehungen sind von Tragödie und Versöhnung geprägt. Seine Beziehung zu Vater ist die bedeutendste, da Vater aus seinem Blut erschaffen wurde und einst sein Lehrer und Begleiter war. Die beiden teilen ein identisches Aussehen und ein Verständnis dafür, was es bedeutet, lebende Steine der Weisen zu sein, doch sie stehen als philosophische Gegensätze da. Während Vater danach strebt, die Menschheit zu transzendieren und alle Emotionen abzulegen, schätzt Hohenheim menschliche Verbindungen und empfindet tiefe Schuld über die Tode, die ihm Unsterblichkeit verliehen. Am Ende empfindet Hohenheim sogar Mitgefühl für Vater, versteht seinen Wunsch nach Freiheit und ist traurig über seinen Tod. Seine Beziehung zu seinen Söhnen, insbesondere zu Edward, ist aufgrund seiner langen Abwesenheit zunächst feindselig. Edward grollt ihm dafür, dass er die Familie verlassen hat und nicht da war, als Trisha starb. Als jedoch die Wahrheit über Hohenheims Mission klar wird, beginnt Edward, die Opfer seines Vaters zu verstehen. Als Edward schließlich Trishas sterbende Worte übermittelt, bricht Hohenheim in Tränen aus, und eine echte Versöhnung beginnt. Seine Beziehung zu seiner Frau Trisha bildet den emotionalen Kern seines Charakters, da sie die einzige Person war, die wusste, was er wirklich war, und ihn trotzdem akzeptierte, ihm einen Grund gab, das Leben zu lieben nach Jahrhunderten der Einsamkeit. Als er erfährt, dass seine Söhne nach der letzten Schlacht sicher und gesund sind, geht er in Tränen der Dankbarkeit und stirbt schließlich friedlich an Trishas Grab, endlich mit ihr im Tod vereint.

Hohenheim besitzt Fähigkeiten, die ihn zu einem der mächtigsten Alchemisten der Serie machen. Als lebender Stein der Weisen hat er Zugang zu enormen Energiemengen, die es ihm ermöglichen, Transmutationen ohne einen konventionellen Kreis und mit weitaus größerer Kraft als gewöhnliche Alchemisten durchzuführen. Sein Körper kann sich sofort von jeder Verletzung regenerieren, wie gezeigt wurde, als er mehrmals von Banditen erschossen wurde und völlig unverletzt aufstand. Er hat Alchemie mehrere Jahrhunderte lang studiert, was ihn in ihren Anwendungen überaus gelehrt macht. Sein Spitzname, Hohenheim des Lichts, kommt von seiner Fähigkeit, Licht selbst zu transmutieren. Nur Vater ist in der Lage, es mit seiner Macht aufzunehmen. Trotz seiner immensen Stärke bevorzugt er friedliche Lösungen und setzt seine Fähigkeiten hauptsächlich ein, um andere zu beschützen und Vaters Pläne zu kontern, anstatt für direkte Kämpfe. Seine größte alchemistische Leistung war die Erschaffung eines landesweiten Gegen-Transmutationskreises, der die gesamte Bevölkerung von Amestris davor rettete, in einen Stein der Weisen verwandelt zu werden.

Im Laufe seiner Entwicklung verwandelt sich Hohenheim von einer in Geheimnisse gehüllten und vermeintlich verantwortungslosen Figur in einen tragischen Helden, dessen Jahrhunderte einsamen Wanderns und Leidens vollständig für das Wohl anderer unternommen wurden. Er beginnt als unsterbliches Wesen, das sich mit einer endlosen Existenz ohne Zweck abgefunden hatte. Die Begegnung mit Trisha und das Bekommen von Kindern geben ihm eine neue Perspektive und einen verzweifelten Wunsch, sterblich zu werden. Sein scheinbares Verlassen seiner Familie wird als ein Akt höchster Selbstaufopferung umgedeutet, indem er die Menschen, die er am meisten liebte, verließ, um sie vor einer Bedrohung zu retten, die sie nicht begreifen konnten. Am Ende seines Lebens erreicht er seine Ziele. Vater wird besiegt, die Nation ist gerettet, und er versöhnt sich mit seinen Söhnen. Nachdem er endlich seinen Zweck erfüllt hat, erlaubt er sich zu sterben, nachdem er lange genug gelebt hat, um Edward ihn zum ersten Mal mit echter Zuneigung Vater nennen zu hören. Seine letzten Momente, die er an Trishas Grab verbringt, repräsentieren das friedliche Ende, das er seit Jahrhunderten gesucht hatte.