Major Motoko Kusanagi, oft mit ihrem militärischen Rang angesprochen, ist die Einsatzleiterin der Öffentlichen Sicherheitsabteilung 9, einer verdeckten Regierungseinheit, die auf Cyberkriegsführung und Terrorismusbekämpfung spezialisiert ist. Ihr Körper ist fast vollständig künstlich, nur ihr Gehirn und ein Teil ihres Rückenmarks sind noch organisch. Ihr Name wird stark als Pseudonym angedeutet, und sie hat so lange unter ihrer operativen Identität gelebt, dass diese effektiv zu ihrem wahren Selbst geworden ist. Kusanagi ist eine Frau von kleiner Statur, 168 Zentimeter groß, mit einem körperlich fitten und athletischen Erscheinungsbild. Ihre Persönlichkeit vereint Professionalität mit einem scharfen Sinn für Humor, oft wechselt sie Sticheleien mit ihren vertrauten Kollegen aus. Sie ist bekannt für ihren provokativen Modestil, den sie als Werkzeug zur Manipulation von Gegnern oder als Teil einer distanzierten Erforschung menschlicher sozialer und sexueller Normen einsetzt. Unter ihrer stoischen Fassade hegt sie tiefe existenzielle Zweifel an der Natur ihres eigenen Bewusstseins und hinterfragt häufig, ob ihre Erinnerungen echt sind und ob eine menschliche Seele wirklich in einer synthetischen Hülle wohnen kann. Diese Suche nach einem Beweis ihrer eigenen Menschlichkeit treibt viele ihrer Handlungen an. Im Einsatz ist Kusanagi eine Meisterin sowohl im physischen Kampf als auch in der elektronischen Kriegsführung. Ihr fortschrittlicher kybernetischer Körper verleiht ihr übermenschliche Kraft, Geschwindigkeit, Beweglichkeit und Widerstandsfähigkeit. Sie ist Expertin in mehreren Kampfkünsten, eine meisterhafte Taktikerin und eine unglaublich präzise Schützin. Ihr Cybergehirn ist mit militärischem Schutz ausgestattet, und sie ist eine weltklasse Hackerin, die zum Ghost-Hacking fähig ist – dem Umschreiben der Erinnerungen oder Persönlichkeit einer anderen Person, der Kontrolle ihrer Wahrnehmungen oder sogar der Fernsteuerung ihrer Körper. Sie verfügt auch über thermo-optische Tarnung, die es ihr ermöglicht, Licht zu beugen und effektiv unsichtbar zu werden. Innerhalb der Abteilung 9 teilt Kusanagi eine tiefe, vertrauensvolle Bindung mit ihrem Partner Batou, der ihr loyaler Unterstützer und Gegenpart ist. Sie hat eine enge Arbeitsbeziehung zu Chef Daisuke Aramaki, der sie angeworben hat, und sie hat Togusa, einen Offizier mit minimaler kybernetischer Aufrüstung, bewusst ins Team geholt, weil sie seine organische Perspektive schätzt. Ihr Pflichtgefühl treibt sie an, andere zu schützen und für Gerechtigkeit zu kämpfen, in dem Glauben, dass sie, weil ihr immense Macht gegeben wurde, die Verantwortung hat, sie einzusetzen. In verschiedenen Handlungssträngen bewegt sich ihre Reise oft von isoliertem Selbstzweifel hin zu einer Form der Transzendenz oder einer Bestätigung ihres Engagements für die Gesellschaft, selbst wenn sie mit der Einsamkeit kämpft, die ihrer einzigartigen Existenz innewohnt.