Oberst Shikishima, meist nur nach seinem Dienstgrad genannt, ist der imposante und standhafte Anführer der Streitkräfte von Neo-Tokio. Ein Mann weniger Worte und von gewaltiger physischer Präsenz, er ist etwa 203 Zentimeter groß, mit einem massigen, muskulösen Körperbau, einem strengen Bürstenhaarschnitt und einem dünnen Schnurrbart, der sein ernstes Antlitz ergänzt. Während er bei politischen Versammlungen in ziviler Kleidung gesehen werden kann, trägt er fast ausschließlich eine Standard-Militäruniform, komplett mit einer Seitenwaffe. Sein prägendstes körperliches Merkmal ist seine schiere, einschüchternde Statur, die er als unausgesprochenes Werkzeug der Befehlsgewalt einsetzt.

Geboren im ursprünglichen Tokio vor dessen Zerstörung, wurde Shikishimas Leben unwiderruflich von der Katastrophe geprägt, die die Stadt dem Erdboden gleichmachte und den Dritten Weltkrieg auslöste. Sein Vater, ein Major der japanischen Bodenselbstverteidigungsstreitkräfte, wurde während der anfänglichen psychischen Explosion getötet, die durch den Esper namens Akira verursacht wurde. Diese persönliche Tragödie scheint seine Entschlossenheit geschmiedet zu haben und trieb ihn dazu, sich an der Nationalen Verteidigungsakademie einzuschreiben. Durch hervorragende Noten und eine klare Begabung für Führungsaufgaben schloss er sein Studium ab und wurde als Oberleutnant in Dienst gestellt, studierte schließlich im Ausland am US-Verteidigungsministerium. Nach seiner Rückkehr nach Japan war er maßgeblich an der Reform der Spezialeinheiten des Landes beteiligt und vereinte später die Land-, See- und Luftverteidigungssysteme, wobei er erfolgreich Japans Unabhängigkeit von dem nach dem Krieg errichteten amerikanischen Schutzschirm aushandelte. Sein wachsender Einfluss wurde jedoch von der Zivilregierung als Bedrohung wahrgenommen, und er wurde faktisch kaltgestellt, indem er zum Kommandeur des streng geheimen Akira-Projekts ernannt wurde, einer Position, die wie eine Sinekure erschien, ihn aber letztlich ins Zentrum der Ereignisse stellte.

Die Persönlichkeit des Obersts ist eine Studie in pragmatischem Stoizismus. Er zeigt eine Fassade unerschütterlicher Ernsthaftigkeit und zeigt selten Emotionen jenseits von kalter Wut oder düsterer Entschlossenheit. Für die Bewohner der weitläufigen, verbrechensgeplagten Metropole mag er wie eine tyrannische Figur erscheinen, doch seine Handlungen werden von einem tiefen, wenn auch zynischen Pflichtgefühl angetrieben. Er hegt eine tiefe Verachtung für Neo-Tokio, das er als Müllhaufen hedonistischer Narren bezeichnet, aber er dient und beschützt es weiterhin, weil, wie er sagt, das die Aufgabe eines Soldaten ist. Dieser Pragmatismus bringt ihn in direkten Konflikt mit den Politikern der Stadt, die er als korrupt und kurzsichtig ansieht. Diese wiederum geben ihm die Schuld daran, dass er Staatsgelder für die Versorgung der Espers verschwendet und für den heruntergekommenen Zustand der Stadt verantwortlich ist, was ihn in Parlamentssitzungen an den Rand offener Wut bringt.

Seine Weltanschauung steht grundlegend im Gegensatz zum wissenschaftlichen Idealismus. Er tut theoretische Wissenschaftler als Romantiker ab und spottet über Doktor Onishis Theorien, dass psychische Kräfte die nächste Stufe der menschlichen Evolution darstellen. Während er glaubt, dass psychische Fähigkeiten zum Wohle der Allgemeinheit genutzt werden könnten, ist er zutiefst skeptisch gegenüber Eingriffen in die Natur. Er ist sich der Schuld der Regierung an der ursprünglichen Katastrophe sehr bewusst und bezeichnet den konservierten Akira als eine Büchse der Pandora, die die Behörden erschaffen und dann zu verstecken versucht haben. Folglich sieht der Oberst, als der Biker Tetsuo Shima beginnt, ähnliche psychische Wachstumsmuster zu zeigen, kein wissenschaftliches Wunder, sondern eine unmittelbare Bedrohung. Er ist der Erste, der dafür plädiert, Tetsuo zu eliminieren, um eine zweite Katastrophe zu verhindern, und er ist sichtlich angewidert von Onishis fasziniertem Interesse an der Zerstörung, die Tetsuo verursacht, und schleudert den Wissenschaftler einmal gewaltsam durch den Raum.

Trotz seiner harten Fassade zeigt der Oberst eine bemerkenswerte und aufrichtige Sanftmut gegenüber den drei Esper-Kindern – Takashi, Masaru und Kiyoko. Anders als die Wissenschaftler, die sie studieren, oder die Politiker, die sie fürchten, interagiert der Oberst auf eine sanfte, fast väterliche Weise mit den Espers und beachtet stets ihre Vorahnungen und Warnungen. Diese väterliche Fürsorge wird erwidert; die Espers vertrauen ihm und respektieren ihn zutiefst und nutzen schließlich ihre Kräfte, um ihn während der endgültigen Zerstörung der Stadt in Sicherheit zu teleportieren, was sein Leben rettet.

Innerhalb der Erzählung dient der Oberst als die primäre Autoritätsperson, die versucht, die Ordnung aufrechtzuerhalten. Er beaufsichtigt das geheime Kinderzimmer, in dem die Espers gehalten werden, und verwaltet die kryogene Aufbewahrung von Akira unter dem Olympiastadion. Zunächst versucht er, Tetsuo als Versuchsobjekt zu kontrollieren, aber als Tetsuos Macht außer Kontrolle gerät, wechselt die Rolle des Obersts zu der eines Jägers. Frustriert über die Unentschlossenheit und politischen Manöver der Regierung, von denen er glaubt, dass sie die Stadt dem Untergang weihen werden, inszeniert er einen Staatsstreich, um die Kontrolle über das Militär zu übernehmen und sich direkt mit Tetsuo zu befassen. Seine wichtigsten Beziehungen sind durch Opposition und widerwillige Allianz geprägt: Er gerät ständig mit dem ehrgeizigen Doktor Onishi aneinander, wird von dem Biker Kaneda vereitelt und wird letztlich von der politischen Führung, der er zu gehorchen geschworen hat, ignoriert. Seine Entwicklung sieht ihn vom gefürchteten Militärbefehlshaber, der einem korrupten System dient, zu einem Abtrünnigen, der bereit ist, dieses System zu stürzen, um seine Kernaufgabe, die Bevölkerung zu schützen, zu erfüllen. Er besitzt selbst keine psychischen Kräfte; seine Fähigkeiten sind rein die eines erfahrenen Strategen, eines Anführers von Männern und eines Soldaten mit dem Nerv, sich mit konventionellen Waffen und purem Willen gegen realitätsverzerrende Kräfte zu stellen.