Mikiya Kokutō ist im März 1995 ein Oberschüler, als er Shiki Ryougi erstmals an einem schneereichen Abend begegnet. Sie werden Klassenkameraden, wobei seine schulischen Leistungen auffallend durchschnittlich sind. Seine Familie besteht aus seinen Eltern und seiner jüngeren Schwester Azaka Kokutō, die nach einem Trennungsgesuch in ihrer Kindheit von ihrem Onkel adoptiert wurde. Mikiya pflegt eine enge Beziehung zu seinem Onkel Daisuke Akimi, einem Detektiv, der altersmäßig eher einem Cousin oder Bruder gleicht. Daisuke zieht Mikiya häufig zu Fällen hinzu, da er dessen investigative Fähigkeiten schätzt.

Äußerlich unscheinbar, aber niedlich, trägt Mikiya typischerweise schwarze Kleidung und markante schwarzgerahmte Brillen. Dieses Erscheinungsbild bleibt bis in seine späten Teenagerjahre bestehen, obwohl er später bleibende Verletzungen erleidet: den Verlust des Sehvermögens im linken Auge und der Beweglichkeit eines Beines nach einem Angriff von Lio Shirazumi.

Seine Persönlichkeit wird durch seinen Ursprung geprägt – „einer, der niemals andere verletzen wird, mehr als jeder andere“ – was ihn zur Normalität drängt. Er ist sanft, aufrichtig, einfühlsam und mitfühlend und zieht natürlich das Vertrauen von Menschen und Tieren auf sich. Obwohl ihm übernatürliche Fähigkeiten fehlen, machen ihn seine deduktiven Fähigkeiten und sein Fleiß zu einem außergewöhnlichen Ermittler. Er zeigt emotionale Zurückhaltung und weint selten; der einzige Vorfall ereignet sich, als er gelobt, Shikis Sünde zu tragen, nachdem sie Lio Shirazumi getötet hat, wobei er eine „blutige Träne“ aus seinem verletzten Auge vergießt. Dies spiegelt seinen Glauben wider, dass Weinen bedeutet, jemanden „besonders“ zu machen, eine Abweichung von seiner Normalität.

Nachdem Shiki aufgrund eines Autounfalls ins Koma fällt, gibt er seine College-Pläne auf und wird Assistent in Touko Aozakis Detektei. Touko schätzt sein Talent, Verborgenes zu finden, was er unter Beweis stellt, indem er ihr Büro trotz schützender Bounded Fields aufspürt. Seine Ermittlungen umfassen die Untersuchung von Selbstmordfällen in den Fujou Apartments und die Erforschung der Bewohner des Ogawa Apartment Complexes über einen Monat hinweg, wobei er Verbindungen zwischen Lio Shirazumi und dem Magier Araya Souren aufdeckt.

Während einer Konfrontation mit Shirazumi im Februar 1999 überlebt er einen tödlichen Angriff knapp, erleidet jedoch bleibende körperliche und psychische Schäden und benötigt drei Monate, um sich von einem drogeninduzierten psychischen Trauma zu erholen. Nach Tōkos Abreise aus Mifune City tritt er der Ryougi-Gruppe als Buchhalter bei. Er heiratet Shiki und nimmt ihren Nachnamen an, wodurch er zu Mikiya Ryougi wird.

In späteren Jahren bleibt er in übernatürliche Angelegenheiten verwickelt. 2007 korrespondiert er mit Touko und bittet Lord El-Melloi II. um Hilfe, um Akira Yakou, einen entführten Verwandten der Ryougi-Familie, zu finden. Diese Entscheidung führt zu Spannungen, da Shiki und andere Ryougi-Mitglieder sich gegen eine Hilfe für die Yakou aussprechen. Seine Rolle als Shikis emotionaler Anker bleibt bestehen und stabilisiert ihre Verbindung zur Welt.

Seine Beziehung zu Shiki entwickelt sich von Freundschaft zu Ehe, geprägt von unerschütterlicher Loyalität. Er besucht sie häufig während ihres Komas; ihre Interaktionen, wie das Teilen von Eis, unterstreichen ihre Bindung. Shiki gibt ihm den Spitznamen „Kokutō“ wegen seiner phonetischen Ähnlichkeit zu „Jean Cocteau“, einem französischen Dichter.