Charlie ist der zentrale Protagonist der Geschichte, ein einzigartiger fünfzehnjähriger Junge, der in Missouri lebt und der einzige Mensch-Schimpanse der Welt ist – ein Hybridwesen, das aus menschlicher DNA und einem Schimpansen entstanden ist. Sein Ursprung geht auf einen Überfall der Animal Liberation Alliance, einer extremistischen Tierrechtsorganisation, auf ein biowissenschaftliches Forschungsinstitut zurück, bei dem ein trächtiger Schimpanse gerettet wurde. Dieser Schimpanse namens Eva gebar Charlie, obwohl er anschließend von einem menschlichen Paar, seinen Adoptiveltern Gilbert und Hannah, aufgezogen wurde und wenig emotionale Bindung zu seiner leiblichen Mutter hat. Charlie besitzt eine Kombination von Fähigkeiten, die ihn sowohl von Menschen als auch von Tieren unterscheiden, darunter eine körperliche Stärke, die die eines Schimpansen übertrifft – er kann das Sechshundertfache seines eigenen Körpergewichts greifen – und eine Intelligenz, die die von Menschen übersteigt.

Was seine Persönlichkeit betrifft, ist Charlie im Allgemeinen ruhig, selbstbewusst und distanziert, und er betrachtet Ereignisse und die Menschen um ihn herum oft mit einer trockenen, logischen Bewertung. Da er vor seinem Eintritt in die Highschool fast keinen Kontakt zu anderen als seinen Eltern hatte, kann er gelegentlich Dinge sagen oder tun, die seine Umgebung verblüffen, da er noch die Nuancen sozialen Verhaltens lernt. Sein Denken ist pragmatisch und ungefiltert; als ein Tyrann eine hypothetische Frage stellt, ob er eine kranke Maus töten würde, um sein eigenes Leben zu retten, antwortet Charlie gelassen, dass er kein Problem damit hätte, den Tyrannen zu erschießen, wenn dieser eine lebensbedrohliche Krankheit in sich trüge. Trotz dieser scheinbar kalten Logik zeigt er eine angeborene Neigung zur Freundlichkeit, die sich zeigt, als er durch ein Fenster stürzt, um ein Mädchen und eine Katze vor einem Sturz zu retten, oder als er einen Schmetterling aus einem Spinnennetz pflückt.

Charlies Hauptmotivation während der gesamten Geschichte ist es, die Menschen zu beschützen, die ihm wichtig sind, insbesondere seine Adoptivfamilie und seine neue Freundin Lucy, ein kluges, aber sozial isoliertes Mädchen, das er in der Schule kennenlernt. Aufgrund seiner einzigartigen Identität versucht die Animal Liberation Alliance, ihn als Symbol für ihre Sache zu rekrutieren, doch Charlie entscheidet sich, die Organisation direkt zu bekämpfen, um seine Lieben zu verteidigen. Im Laufe der Geschichte reist er auch nach New York, um einen Wissenschaftler namens Dr. Grossman zu finden und Antworten über seine eigenen Ursprünge zu suchen.

Seine Beziehung zu Lucy ist zentral für seine Entwicklung. Sie ist eine der ersten Menschen in seinem Alter, die ihn nicht als Spektakel behandelt, und ihre Bindung wächst, während sie gemeinsam die Herausforderungen von Diskriminierung, Terrorismus und sozialen Konflikten bewältigen. Ihre Kommunikation ist einzigartig; Charlie gibt oft leicht schräge Antworten, die Lucy durch das Beobachten seiner subtilen Augenbewegungen und Reaktionen interpretiert, und diese Dynamik schafft eine Verbindung, die der ursprüngliche Schöpfer als eine beschreibt, in der zwei verschiedene Wesen versuchen, einander zu verstehen, während sie akzeptieren, dass vollständiges Verständnis möglicherweise nicht notwendig ist. Durch seine Interaktionen mit Lucy beginnt Charlie sich zu verändern und zu entwickeln, obwohl seine Gefühle oft schwer zu lesen sind. Gleichzeitig zeigt er eine kalte Gleichgültigkeit gegenüber seiner leiblichen Mutter, dem Schimpansen Eva, bezeichnet sie lediglich als seine leibliche Mutter und zeigt keine sentimentale Bindung. Seine Existenz zwingt die Menschen um ihn herum, ihre ethischen Beziehungen zu Tieren, Technologie und dem Leben selbst zu überdenken, und er stellt grundlegende Fragen an die menschliche Zivilisation, wie zum Beispiel, warum Menschen die einzigen Wesen sind, die nicht getötet und gegessen werden dürfen.