Manabu Midoro ist der Sohn von Dr. Midoro, einem Nobelpreisgekrönten Biologen, der zu den ersten Menschen gehört, die den Warnungen der Mikroiden Yanma, Ageha und Mamezo Glauben schenken. Obwohl er das Kind eines gefeierten Wissenschaftlers ist, wird Manabu als leistungsschwacher Schüler dargestellt, der eine Klasse in der Mittelschule wiederholt hat. Er war Mitglied des Kendo-Clubs seiner Schule, bis er ausgeschlossen wurde, und er führt weiterhin ein Bambusschwert (Shinai) als seine Hauptwaffe im Kampf. Seine Persönlichkeit ist geprägt von einer schnellen Neigung zu erröten, wenn er attraktiven Mädchen begegnet, was eine schüchterne und beeindruckbare Seite offenbart.

Manabus zentrale Motivation ist es, seinen Vater und die Mikroiden in ihrem Kampf zu unterstützen, die Menschheit vor dem Insektenreich Gidoron zu schützen. Er schließt sich Dr. Midoro an, um den drei winzigen Helden Zuflucht und Hilfe zu bieten, und agiert als jugendlicher Verbündeter, der in Situationen handeln kann, in denen die Anwesenheit eines Erwachsenen Verdacht erregen könnte. Seine Rolle in der Geschichte ist die einer menschlichen Brücke zwischen der gewöhnlichen Gesellschaft und dem außergewöhnlichen Konflikt, der sich in einem winzigen Maßstab abspielt. Er ist oft derjenige, der praktische Aufgaben übernimmt und seine Kendo-Fähigkeiten einsetzt, um sich gegen kybernetische Insektenbedrohungen zu verteidigen.

Seine primäre Beziehung ist die zu seinem Vater, Dr. Midoro, mit dem ihn ein Band des Vertrauens und der gemeinsamen Zielsetzung verbindet. Er entwickelt auch eine kooperative Freundschaft mit den Mikroiden, insbesondere Yanma, und erweist sich als loyaler Begleiter bei ihren gefährlichen Missionen. Im Laufe der Serie wächst Manabu von einem etwas eigenwilligen Schüler zu einer mutigeren und verantwortungsvolleren Figur heran, obwohl seine impulsive und gelegentlich komödiantische Reaktion auf Romanzen ein beständiges Merkmal bleibt. Zu seinen bemerkenswerten Fähigkeiten gehören sein Kendo-Training, das ihm eine praktische Kampffertigkeit gegen die insektoiden Feinde verleiht, und seine Bereitschaft zu handeln, trotz seiner gewöhnlichen menschlichen Grenzen. Diese Kombination aus jugendlicher Verletzlichkeit, Loyalität und einem Hauch von Kampfdisziplin definiert ihn als eine nachvollziehbare menschliche Präsenz inmitten der fantastischen Elemente der Geschichte.