Endō Naotsune diente als Vasall des Azai-Clans während der Sengoku-Zeit in Japan. Er lehnte die politische Heirat zwischen seinem Herrn, Azai Nagamasa, und Oda Nobunagas Schwester, Oichi, ab, da er Nobunaga als eine ernsthafte Bedrohung für den Azai-Clan betrachtete. Aus Loyalität bat er nach ihrem ersten Treffen um Erlaubnis, Nobunaga zu ermorden, was Nagamasa jedoch ablehnte.
In der Schlacht von Anegawa im Jahr 1570 tarnte Naotsune seine Truppen als Oda-Verbände, um Nobunagas Lager zu infiltrieren. Die Taktik wurde aufgedeckt, und Takenaka Kyusaku – der jüngere Bruder von Takenaka Hanbei – tötete Naotsune, als dieser auf Nobunagas Hauptquartier vorrückte. Historische Aufzeichnungen bescheinigen ihm, in diesem Gefecht zehn Oda-Krieger getötet zu haben, was seinen Ruf als gefürchteter Kämpfer unterstreicht.
Neben dem Kriegswesen stiftete Naotsune 1569 ein illustriertes Gedicht an das Taga-taisha-Schrein; dieses Artefakt ist bis heute erhalten. In der dritten Staffel des Anime *Ninja Girl & Samurai Master* (*Nobunaga no Shinobi: Anegawa Ishiyama-hen*) erscheint er als historische Figur, optisch mit einer Glatze dargestellt, was seiner Rolle als feudaler Vasall entspricht.