Fleur-de-lis, alias Lysandre, führt Team Flare als rätselhafter Anführer und leitet die Lysandre Labs in der Kalos-Region. Seine Mission konzentriert sich darauf, Informationen über Mega-Entwicklung zu kontrollieren, um ihren Missbrauch durch kalkulierte Manipulation und verdeckte Operationen einzudämmen. Er trifft erstmals auf Alain während der Suche nach einem Denryunit in alten Ruinen und bietet den Stein als Preis für den Sieg in ihrem Kampf an. Nachdem er Alain besiegt hat, wirbt er ihn unter dem Vorwand an, den Ruf von Professor Sichel zu schützen, und stattet ihn mit einem Key Stone und Charizardit X aus, während er seine wahren Absichten verbirgt.
Später organisiert Lysandre Alains Training durch eine anstrengende Serie von Kämpfen gegen zehn Mega-Entwicklungs-Nutzer und droht bei einer Niederlage mit dem Entzug seines Mega-Rings. Diese Prüfung dient einem doppelten Zweck: Alains Entschlossenheit zu testen und Daten über die Energie-Muster der Mega-Entwicklung zu sammeln. Gleichzeitig arbeitet er mit Wissenschaftlern zusammen, um den Giant Rock zu analysieren, ein Relikt, das uralte Energiesignaturen aussendet, das er in einer Abschirmungseinheit isoliert, um eine regionale Katastrophe zu verhindern. Gespräche mit Steven Stone zeigen seine methodische Neugier an historischen Artefakten und den Ursprüngen der Mega-Entwicklung, doch er geschickt weicht Fragen zu seinen ultimativen Zielen aus.
Experimente mit Zygarde-Kernen und grünen zellulären Entitäten geraten außer Kontrolle, als Chespie, ein Chespin in seinem Gewahrsam, nach der Aufnahme instabiler Energie ins Koma fällt. Während er öffentlich verspricht, Chespie zu heilen, nutzt Lysandre die Krise heimlich, um Alain zu zwingen, die Forschung zu beschleunigen, und stellt die Vollendung des Mega-Entwicklungssystems als Chespies einzige Hoffnung dar – eine Taktik, die seine Unterordnung der Ethik unter den wissenschaftlichen Fortschritt verdeutlicht.
Spannungen entstehen mit Malva, einem Mitglied der Kalos-Elite, die seine Absichten während Alains entscheidendem Kampf hinterfragt. Lysandre lenkt ihren Zweifel ab, indem er den Fokus auf Alains Erfolge lenkt. Insgeheim plant er die Erfassung von Zygarde-Kernen und verfolgt die Energieschwankungen des Giant Rock, um seine Vision einer gesellschaftlichen Umstrukturierung durch gezielte Machtanwendung voranzutreiben.
Lysandres Kampfstrategie spiegelt seine kalkulierte Natur wider, indem er Pyroar und ein Shiny Mega-Gyarados mit Hyperstrahl und Einäschern einsetzt. Diese Konfrontationen dienen sowohl als Prüfungen für Verbündete wie Alain als auch als Demonstration seiner Kampfkünste. Seine übergreifende Erzählung verfolgt konsequent eine Philosophie der Auslöschung menschlicher Unvollkommenheiten, wobei die Anime-Version mehr auf Täuschung und datengetriebene Machenschaften setzt als auf die apokalyptischen Töne seiner Spiel-Variante.
In den Spielen werden Verbindungen zu königlichen Vorfahren in Kalos angedeutet, während die Anime-Geschichte seine Vergangenheit im Unklaren lässt – bestätigte Verbindungen zu Professor Sichel gibt es vor ihren dokumentierten Begegnungen nicht. Diese Dualität als Förderer und Widersacher schafft komplexe Dynamiken, die Alains Mentorschaft mit hinterhältigen Manövern verbinden, um seinen ideologischen Plan schrittweise zu verwirklichen.