Yama, in einigen Adaptionen auch als Logan bekannt, stammt aus einer Gaia-Sanktion-Kolonie auf dem Mars. Er verbindet eine familiäre Bindung mit seinem älteren Bruder Ezra und seiner Jugendfreundin Nami. Ein prägendes Kindheitsereignis war, als eine versehentliche Explosion in einem Gewächshaus, ausgelöst durch Yamas Versuch, die Blumen seiner Mutter wiederherzustellen, Ezra lähmte und Nami auf Lebenserhaltungssysteme angewiesen sein ließ. Diese Tragödie lastete schwer auf Yama und erfüllte ihn mit tiefster Schuld. Auf der Suche nach Erlösung nahm er Ezras Mission an, sich in das Raumschiff von Captain Harlock, die Arcadia, einzuschleusen, mit dem Auftrag, Harlock zu fangen oder zu töten.
Er gelangte erfolgreich an Bord der Arcadia und diente zunächst unter dem Crewmitglied Kei Yuki. Seine tödliche Präzision, insbesondere mit den Geschütztürmen des Schiffs, brachte ihm Anerkennung ein. Während einer Mission, um eine Vibrationsbombe zu platzieren, opferte er sich, um Kei zu retten, was zu einer Konfrontation mit Harlock führte, in der Yama seinen wahren Zweck gestand. Harlock, der die Verschwörung bereits durchschaut hatte, enthüllte Yamas entbehrlichen Status für die Gaia-Sanktion. Dies veranlasste Yama zum Überlaufen, nachdem Harlock ihm einen Platz an Bord anbot.
Seine Loyalität blieb jedoch instabil. Bei seiner Rückkehr ins Sonnensystem und der Konfrontation mit Ezra erfuhr Yama von Harlocks wahrem Ziel: die Detonation von 100 Bomben, um das bestehende Universum zu vernichten und einen neuen Urknall auszulösen, was der Überzeugung der Crew von einem bloßen Zeitreset widersprach. Gleichzeitig enthüllte Ezra Harlocks Verantwortung für die Verwüstung der Erde durch ein gescheitertes Dunkle-Materie-Experiment. Yama, der sich verraten fühlte, stellte sich auf Ezras Seite und ermöglichte die Gefangennahme Harlocks und der Crew. Diese Entscheidung wurde erschwert, als Ezra Nami während eines Streits ermordete, in dem sie ihre Liebe zu Yama gestand und Ezra zurückwies. Von Wut und Trauer überwältigt, stieg Yama auf die öde Oberfläche der Erde hinab und entdeckte blühende Blumen – Beweis dafür, dass das Leben weiterbestand. Dies bestärkte ihn in seiner Ablehnung sowohl von Harlocks Nihilismus als auch der Täuschung der Gaia-Sanktion.
Bewaffnet mit der Blume als Beweis befreite Yama die Arcadia-Crew und schloss sich ihnen wieder an. Er half dabei, die holographische Verschleierung des wahren Zustands der Erde durch die Gaia-Sanktion aufzudecken und untergrub damit ihre Autorität. In einer späteren Schlacht kaperte Ezra die Arcadia. Ihr Schwerelose-Kampf endete damit, dass Ezra Yama erschoss, was eine Narbe auf seinem Gesicht hinterließ und sein rechtes Auge verletzte. Harlock griff ein und verletzte Ezra tödlich. Sterbend behauptete Ezra mehrdeutig, seine Taten seien von Liebe zu Nami motiviert gewesen. Als die Arcadia auf der Erde abstürzte, bereitete Harlock den finalen Zünder vor, überließ die Entscheidung jedoch Yama. Yama entschied sich, das Universum zu verschonen und erklärte die Erde zu einem „Geschenk von Nami und Ezra“. Harlock übergab Yama sein charakteristisches Augenklappe, was symbolisch die Kapitänswürde übertrug. Yama übernahm das Kommando der Arcadia und nahm die Identität des nächsten Captain Harlock an.
Äußerlich hat Yama schulterlange braune Haare, hellbraune Augen und einen schlanken Körperbau. Seine Kleidung wechselte von einem blauen Gaia-Sanktion-Uniform zu einem schwarzen Piratenoutfit mit einem Jolly-Roger-Emblem. Ezras Angriff hinterließ eine auffällige Narbe über seinem rechten Auge, die später von Harlocks Augenklappe verdeckt wurde. Zu seinen Fähigkeiten zählen der versierte Umgang mit Schusswaffen und eine natürliche Begabung für die Bedienung der Waffensysteme der Arcadia. Nachdem er die Akzeptanz des Schiffs gewonnen hatte, zeigte er die Fähigkeit, seine Dunkle-Materie-Triebwerke zu nutzen.