Lieutenant Tony Daugherty befehligte das Roughnecks A-01 Team an Bord der FAS Alesia. Seine Führung verband ruhige Gelassenheit mit der Härte eines Drill-Sergeants. Als Kommandant leitete Daugherty die entscheidende Rettungsaktion des A-01 Teams in Fort Casey und evakuierte erfolgreich Überlebende des eingekesselten K-12 Teams. Nach dieser Mission nahm er an Strategiebesprechungen an Bord der Alesia teil, die Major Varros ungeklärte Inhaftierung betrafen, und koordinierte später Truppenbriefings gemäß den Befehlen von General Rico. Während des nachfolgenden Einsatzes auf dem beschädigten Raumschiff *John A. Warden* erhielt Daughertys Team den kritischen Auftrag, Captain Ibanez unter schwerem Arachniden-Beschuss zur Brücke zu eskortieren. Daugherty schützte Captain Ibanez aktiv vor Arachniden-Angriffen, als sich die Lage verschlechterte. Er kam beim Absturz der *John A. Warden* in den französischen Alpen ums Leben. Posthum nutzten die Arachniden Daughertys Körper als Medium, um Major Varro Forderungen bezüglich Carl Jenkins zu übermitteln. Körperlich war Daugherty ein weißer Schütze mit schwarzen Haaren und braunen Augen im Rang eines Lieutenants.