Misaki Takahashi ist der Hauptprotagonist der Junjō-Romantica-Handlung innerhalb der Junjō-Romantica-Reihe. Er erscheint erstmals als achtzehnjähriger Oberschüler, der bei seinem älteren Bruder Takahiro Takahashi lebt. Als Misaki acht Jahre alt war, starben beide Eltern bei einem Autounfall, und sein Bruder gab seinen eigenen Traum, die Universität zu besuchen, auf, um zu arbeiten und ihn großzuziehen. Misaki trägt ein tiefes Schuldgefühl über den Tod seiner Eltern und die Opfer, die sein Bruder gebracht hat, was sein starkes Verantwortungsbewusstsein und seinen Wunsch, akademisch erfolgreich zu sein, antreibt. Um ihm die Zulassung zu einer wettbewerbsorientierten Universität zu erleichtern – derselben, die sein Bruder besuchen wollte – arrangiert Takahiro, dass sein bester Freund, der berühmte Romanautor Akihiko Usami, Misaki Nachhilfe gibt. Anfangs mag Misaki Usami nicht, nachdem er entdeckt, dass Usami Boys-Love-Romane schreibt, in denen Takahiro als Figur vorkommt. Im Laufe der Zeit fühlt sich Misaki jedoch allmählich zu Usami hingezogen, und nachdem Takahiro beruflich nach Osaka versetzt wird, zieht Misaki in Usamis Haus ein. Misaki hat keine vorherige Erfahrung mit Romantik oder Verabredungen, und er kämpft intensiv mit der Verleugnung seiner wachsenden romantischen Gefühle für einen Mann. Sein innerer Konflikt ist ein zentraler Teil seiner emotionalen Reise. Im Laufe der Serie entwickelt sich Misaki von einem unsicheren und schuldbeladenen Teenager zu einem selbstbewussteren jungen Erwachsenen, der lernt, seine Gefühle zu akzeptieren und seine Beziehung zu Usami zu navigieren. Er bleibt ein akademisch fokussierter Student, besonders stark in Literatur, obwohl er keine übernatürlichen Fähigkeiten besitzt. Seine Bindung zu seinem Bruder Takahiro ist grundlegend für seine Motivationen und emotionalen Lasten, während seine Beziehung zu Usami der primäre romantische und persönliche Entwicklungsbogen seiner Geschichte ist. Misakis Loyalität, Sensibilität und allmähliche Selbstakzeptanz definieren seine Rolle als Erzähler und Protagonist des Romantica-Bogens.