Katsura Kotarou erlitt früh eine Tragödie, als eine Krankheit seine Eltern dahinraffte und ihn und seine Großmutter obdachlos zurückließ. Von ihr lernte er eine wichtige Kriegerphilosophie: Überleben und Vorsicht waren für eine Führungsperson von höchster Bedeutung, was erforderte, "sowohl feiger als auch stärker als alle anderen" zu sein, um andere zu schützen. Nach ihrem Tod sicherte sich sein Intellekt ein Stipendium für eine Militärschule. Dort schloss er Freundschaft mit Takasugi Shinsuke. Als sie die Lehren von Yoshida Shouyou entdeckten, verließen beide zusammen mit Sakata Gintoki die formale Ausbildung.
Im Joui-Krieg kämpfte Katsura an der Seite von Gintoki, Takasugi und Sakamoto Tatsuma, um Shouyou aus den Händen des Bakufu zu befreien. Gefangen genommen, wurden sie gezwungen, Shouyous Hinrichtung mitanzusehen, die von Gintoki vollstreckt wurde. Dieses Ereignis hinterließ bei Katsura tiefe Narben, doch sein Widerstand gegen das Regime hielt an. Nach dem Krieg führte er eine gemäßigte Joui-Fraktion, die strategische Rückzüge und Ausweichmanöver einsetzte, was ihm den Spitznamen "Flüchtender Kotarou" einbrachte. Seine anfänglichen Taktiken umfassten Bombenanschläge auf Botschaften der Amanto und Symbole der Regierung, die jedoch stets als Sachbeschädigungen ohne Opfer gemeldet wurden, was auf seine Zurückhaltung hindeutete.
Seine Methoden entwickelten sich von offener Gewalt zu subtilerem Widerstand, wobei er Priorität auf Informationsbeschaffung, das Einschleusen von Spionen und die Förderung anti-Bakufu-Stimmung durch geheime Netzwerke legte. Dieser Wandel wurde durch Gintokis Ablehnung eines fortgesetzten Krieges und Katsuras Bindung zu Ikumatsu, einer Witwe, die einen Ramenladen betrieb, beeinflusst. Er entwickelte eine auffällige Vorliebe für Hausfrauen, insbesondere Witwen und untreue Ehefrauen, die auf eine Kindheitsliebe zu einer verwitweten Nachbarin zurückging. Für öffentliche Aktivitäten benötigte er häufige Verkleidungen – wie "Zurako", "Captain Katsura" oder "DJ Ozura" – die jedoch oft Verfolger wie die Shinsengumi nicht täuschten.
Katsura verband Exzentrizität mit taktischem Scharfsinn. Oft wurde ihm mangelnder Hausverstand nachgesagt – er vermenschlichte Gegenstände oder missinterpretierte einfache Vokabeln – doch zeigte er in Führung und Kampf bemerkenswerte Intelligenz. Er führte einen bescheidenen Lebensstil, bevorzugte einfache Mahlzeiten wie Soba und den Snack "Nmaibo" und zeigte Höflichkeit durch Ehrenbezeichnungen wie "dono" und Geschenke, um keine Missstimmung zu erregen. Stets begleitet wurde er von Elizabeth, einem rätselhaften, entenartigen Gefährten, der über Schilder kommunizierte.
Im Kampf bewies er meisterhafte Schwertkunst, die unter Shouyou geschliffen wurde, verstärkt durch überlegene Kraft, Geschwindigkeit und Ausdauer, die er gegen Gegner wie Neptune Shoukaku unter Beweis stellte. Seine Erfindungsgabe ging über kämpferische Fähigkeiten hinaus: Er konstruierte Sprengstoffe, hackte Kommunikationssysteme, verwandelte Alltagsgegenstände wie Famicom-Kassetten in Waffen und integrierte verdauungsfördernde Lebensmittel in seinen Kampfstil. Zudem besaß er eine einzigartige Immunität, indem er Viren absorbierte, um sein Immunsystem zu stärken, was ihn gelegentlich in "Ill Smith" verwandelte.
Nach dem Zusammenbruch des Bakufu diente Katsura zunächst als Premierminister während des Wiederaufbaus, nahm später jedoch wieder Untergrundaktivitäten auf. Seine letzte Darstellung zeigt ihn als Vigilanten, der revolutionäre Ideale mit dem Schutz der Bürger Edos in Einklang bringt. Historisch inspiriert ist die Figur von Katsura Kogoro (später Kido Takayoshi), einer Persönlichkeit der Bakumatsu-Zeit, die für ihre Fluchtkünste bekannt war und somit das "Flüchtender Kotarou"-Image widerspiegelt.