Isao Kondou ist der Kommandeur der Shinsengumi, einer Spezialpolizeitruppe. Seine Vorgeschichte beginnt in einem Dōjō in Bushū, wo er trainierte und schließlich Hijikata Toushirō und Okita Sōgo anwarb. Er führte diese Gruppe nach Edo und verwandelte das Dōjō in die Organisation, die als Shinsengumi bekannt wurde. Er ist ein großer, muskulöser Mann mit einem auffallend behaarten Erscheinungsbild, das ihm häufig den Spitznamen Gorilla einbringt.

Seine Persönlichkeit ist von einem auffälligen Widerspruch geprägt. Er wird oft als alberner und realitätsferner Charakter dargestellt, am bekanntesten für sein obsessives Stalking von Shimura Tae, die er heiraten möchte. Regelmäßig erscheint er nackt, eine Angewohnheit, von der er glaubt, dass sie ein ehrliches und reines Herz demonstriert. Trotz dieser absurden Eskapaden wird er weithin als die Seele der Shinsengumi verehrt. Er wird durchgängig von anderen als ehrlich, rein und mit einem unerschütterlichen Willen beschrieben. Diese aufrichtige Natur ist die Hauptquelle der tiefen Loyalität, die seine Untergebenen ihm entgegenbringen. Seine Motivationen werden größtenteils von seiner anhaltenden Zuneigung zu Shimura Tae und seinem leidenschaftlichen, beschützenden Engagement für die Shinsengumi angetrieben, die er als Familie betrachtet.

In der Geschichte dient Kondō Isao als wichtige Nebenfigur und Anführer der Shinsengumi, der die Einsätze der Truppe überwacht und häufig als Verbündeter der Hauptprotagonisten fungiert, während er gleichzeitig eine Hauptquelle der Komik ist. Seine Schlüsselbeziehungen definieren ihn stark. Hijikata Toushirō, sein Vizekommandeur, dient als seine feste rechte Hand und wird als das Schwert beschrieben, das seine Seele beschützt. Okita Sōgo, ein enger Freund und Untergebener, neckt ihn oft gnadenlos, bleibt ihm aber dennoch absolut treu. Seine einseitige Dynamik mit Shimura Tae ist ein zentraler Running Gag, entwickelt sich jedoch im Laufe der Serie zu einem freundschaftlicheren und häuslichen Verhältnis.

Im Laufe der Serie durchläuft Kondō Isao eine bedeutende Entwicklung. Der Meuterei-Arc betont seine unersetzliche Rolle als der reine und unbefleckte Kern der Shinsengumi. Er entwickelt sich von einem Anführer, der oft stark auf Hijikata angewiesen ist, zu einem reiferen und fähigeren Kommandeur. Seine Beziehung zu Tae reift von reiner Besessenheit zu einem Punkt, an dem er für ihre Familie kochen und freundschaftlicher mit ihr interagieren kann. Was seine Fähigkeiten betrifft, ist Kondō Isao ein mächtiger Schwertkämpfer, der einen direkten, auf einen Treffer ausgelegten Stil bevorzugt. Er verfügt über beeindruckende körperliche Stärke und Ausdauer. Seine bedeutendste Fähigkeit ist jedoch seine charismatische Führung, die die notorisch chaotischen Shinsengumi durch reine Willenskraft und unerschütterliche Integrität vereint.