Pandora wurde in Deutschlands adlige Familie Heinstein hineingeboren und genoss eine privilegierte Kindheit in ihrem Schloss. Während einer verbotenen Erkundung eines verfallenen Gutshauses entdeckte sie eine versiegelte Box mit Athenas Insignien. Als sie sie öffnete, befreite sie die Zwillingsgötter Hypnos und Thanatos. Diese informierten sie, dass Hades bald als ihr Bruder wiedergeboren werden würde, und gewährten ihr das Kommando über seine zukünftige Armee von 108 Spectern sowie ewiges Leben, unter der Bedingung, dass sie Hades bis zur finalen Schlacht beschützte. Als Hades durch ihre Mutter geboren wurde, raffte der Tod alles Leben im Schloss dahin – ihre Eltern, Diener, Haustiere und Pflanzen – und ließ Pandora als einzige Überlebende zurück. Dieses Ereignis verwandelte das Schloss in eine Domäne des Todes und markierte den Beginn ihres Dienstes für Hades. Als Erwachsene wurde sie zur Hauptverwalterin der Unterwelt und besaß absolute Autorität über Hades' Streitkräfte. Sie erzwingt Loyalität gnadenlos, wie etwa durch die Folter des Specters Wyvern Rhadamanthys, der Hades' Befehle missachtet hatte. Zu ihren Aufgaben gehörte es, einen menschlichen Körper für Hades' Reinkarnation zu sichern. Sie reiste nach Japan und identifizierte Shun von Andromeda als idealen Wirt. Nach einer Konfrontation mit Shuns Bruder Ikki implantierte sie Shun ein Medaillon, um eine Verbindung zu Hades herzustellen, und löschte die Erinnerung an die Begegnung aus Ikkis Gedächtnis. Später legte sie eine Falle für den Silberheiligen Lyra Orphée, der seine Geliebte Eurydike wiederbeleben wollte. Obwohl sie kurz von seiner Musik gerührt war, befahl sie dem Specter Sphinx Pharao, seine Flucht aus der Unterwelt zu verhindern. Während des Heiligen Krieges leitete Pandora die Invasion von Athenas Sanctuary. Ihre Führung wurde auf die Probe gestellt, als die abtrünnigen Goldsaintes Saga, Camus und Shura Athenas scheinbar leblosen Körper übergaben. Sie deckte ihren Betrug auf, als sie sich weigerten, den Körper herauszugeben, was zu einer Konfrontation führte, bei der der Specter Frog Zelos gefroren wurde und Pandora bedroht wurde. Als der Krieg in die Unterwelt verlegt wurde, traf sie erneut auf Ikki. Als sie seinen Entschluss sah, Shun zu beschützen, widersetzte sie sich Hades, indem sie Ikki ihr interdimensionales Halsband schenkte – ein Geschenk von Hades, das Reisen zwischen Welten wie Elysion ermöglichte. Diese Tat stellte ihre Fähigkeit wieder her, Farben zu sehen, die sie während ihrer Dienstzeit verloren hatte. Thanatos, der sie als Verräterin betrachtete, exekutierte sie. Im Spin-off *The Lost Canvas* weicht Pandoras Hintergrundgeschichte ab. Sie wird in jedem Heiligen Krieg wiedergeboren, um Hades' Wirt auszuwählen. Als Kind freundete sie sich mit Partita an, befahl jedoch später ihre Ermordung, nachdem sie fälschlicherweise annahm, Partita habe Hades' Seele gestohlen, was zum Tod von Partitas kleinem Sohn Tenma führte. Als Erwachsene diente Pandora Hades mit paranoider Hingabe und versiegelte ihn, damit er sich auf das Malen der weltzerstörenden "Lost Canvas" konzentrieren konnte. Als sie entdeckte, dass ihr Kindheitsfreund Alone nur Hades' Wirt – nicht der Gott selbst – war, suchte sie Rache, wurde jedoch vom Specter Owl Partita tödlich verwundet. Tenma beschützte sie während ihres Kampfes, und sie überlebte, um weiterhin Hades' Armee zu dienen, bevor sie die versiegelten Seelen von Hypnos und Thanatos zum Schloss Heinstein brachte.