Genryūsai Shigekuni Yamamoto gründete die Gotei 13 vor etwa 1.000 Jahren und diente als deren Captain-Kommandant. Jahrhunderte zuvor, etwa 2.100 Jahre vor den Hauptereignissen, etablierte er die Genryū- und Genji-Schule, den Vorläufer der Shin'ō-Akademie. Als Hauptausbilder unterrichtete er persönlich die zukünftigen Captains Shunsui Kyōraku und Jūshirō Ukitake und zeigte später Stolz auf deren Leistungen. In dieser Ära suchte der junge Chōjirō Sasakibe ihn wiederholt auf und nannte ihn "Eijisai-dono" aufgrund einer Narbe auf Yamamotos Stirn, die dem Zeichen "丿" (ei) ähnelte. Sasakibe erklärte seine Absicht, Yamamotos rechte Hand zu werden, nicht sein Schüler, was zu einem Kampf führte, in dem Sasakibe sein Bankai, Kōkō Gonryō Rikyū, entfesselte. Dieser Angriff hinterließ eine zweite Narbe, die die erste kreuzte und ein "X" bildete. Die daraus resultierende Markierung veranlasste andere, Yamamoto "Jūjisai" (十字斎) zu nennen, doch Sasakibes Weigerung, den neuen Namen zu verwenden, führte dazu, dass Yamamoto "Genryūsai" annahm – ein Beiname, der seine Rolle als Gründer widerspiegelt ("Gen-" bedeutet Ursprung) und kulturelle/spirituelle Konnotationen im Zusammenhang mit Zeit und dem Weidenbaum einbezieht. Bei der Gründung der Gotei 13 rekrutierte Yamamoto den berüchtigten Verbrecher Yachiru Unohana als Gründungs-Captain. Etwa zur gleichen Zeit konfrontierte er den Quincy-Kaiser Yhwach, angeführt von den ursprünglichen Captains und Chōjirō Sasakibe. Obwohl Yamamoto Yhwach besiegte und die Quincy-Eliten Seydlitz, Huburt und Algora eliminierte, gelang es ihm nicht, den finalen Schlag zu landen. Yhwach charakterisierte Yamamoto aus dieser Zeit als jemanden, der Menschen und Untergebene als entbehrlich betrachtete. Nach dem Konflikt nahm Yamamoto einen Ehrenkodex und Gerechtigkeit an und verwarf wahllose Opfer. Später bot er Sajin Komamura trotz dessen nicht-menschlicher Herkunft eine Position in der Gotei 13 an und griff in Kenpachi Zarakis Captain-Ausbildung ein. Das Zentral 46 beendete diese Ausbildung aus Angst vor Zarakis potenzieller Rebellion. Yamamotos gealtertes Erscheinungsbild spiegelt seine immense Seniorität als ältester Captain der Gotei 13 wider. Er wirkt wie ein alter Mann mit kahlem Kopf, tiefen Falten und einem langen weißen Bart, der von einem violetten Band gehalten wird. Auffällige Narben zeichnen seinen Körper, insbesondere die gekreuzten Narben über seinem rechten Auge von Sasakibes Angriff. Er trägt die standardmäßige Shinigami-Uniform mit seinem Captain-Haori, der locker über seinen Schultern hängt. Trotz seines gebrechlichen Auftretens besitzt er eine muskulöse Statur, die nur im Kampf sichtbar wird. Er verlor seinen linken Arm während einer Auseinandersetzung mit Sōsuke Aizen. In seiner Jugend hatte er schwarzes Seitenhaar, das zu einem Topknoten gebunden war, dicke Augenbrauen, einen Schnurrbart und trug einen ärmellosen Haori über seiner Shinigami-Kleidung. Yamamoto verkörpert unerschütterliche Überzeugung und strikte Einhaltung der Gesetze der Soul Society und verlangt dasselbe von anderen. Er zeigt keine Toleranz für Ungehorsam und reagiert aggressiv auf Verrat, oft bezeichnet er Gegner als "Jungspund" und inszeniert Kämpfe als "Bestrafungen". In Friedenszeiten wirkt er gebrechlich – schläft sogar im Stehen – und zeigt selten Bestürzung, meist vermittelt er Ernsthaftigkeit, indem er leicht die Augen öffnet. Seine Loyalität gegenüber der Soul Society ist absolut; er opferte sich und die Gotei 13 freiwillig, um Aizen aufzuhalten, und betrachtete dies als Pflicht. Er schätzt den Captain-Haori zutiefst als Symbol des Rangs und wird sichtlich wütend, wenn Captains wie Kyōraku oder Byakuya ihren verlieren, ohne Reue zu zeigen. Trotz seiner Strenge zeigt er differenzierte Mitgefühle: Er zögerte, das kindliche Wonderweiss Margela anzugreifen, äußerte Mitleid mit Wonderweiss' geschwächtem Verstand und lobte die Tres Bestias für ihren Mut, bevor er sie nicht-tödlich besiegte. Seine Wut auf Driscoll Berci für die Verwendung von Sasakibes gestohlenem Bankai unterstrich seinen tiefen Respekt für seinen Leutnant. Kulturell bevorzugt er östliche Traditionen, beherrscht die japanische Teezeremonie und veranstaltet monatliche Sitzungen für seine Division, während er westliche Bräuche, die Sasakibe bevorzugte, ablehnt. Er pflegt persönliche Rituale wie monatliches Bartflechten und Sonnenbaden, während er mit einem trockenen Tuch abgerieben wird. Yamamoto's Kampfkraft resultiert aus über zwei Jahrtausenden der Beherrschung der Shinigami-Künste. Sein Zanpakutō, Ryūjin Jakka, ist das älteste und eines der mächtigsten in der Soul Society. Im versiegelten Zustand ist es ein Holzstab, der sich bei der Freisetzung in ein Katana verwandelt. Sein Shikai-Kommando, "All Things in the Universe, Turn to Ashes", entfesselt Flammen, die alles Berührte verbrennen, noch meilenweit wahrnehmbar. Techniken umfassen Jōkaku Enjō (Einschließen von Zielen in sphärischen Feuerwänden); Taimatsu (präzise Flächenverbrennung); und Ennetsu Jigoku (ein hochriskantes Säulenangriff, der auch Yamamoto gefährdet). Sein Bankai, Zanka no Tachi, bündelt alle Flammen in einer geschwärzten Klinge und erhöht die Umgebungstemperaturen tödlich. Es manifestiert vier Formen: Higashi: Kyokujitsujin (löscht alles aus, was die Klinge berührt); Nishi: Zanjitsu Gokui (umhüllt Yamamoto mit unsichtbaren defensiven Flammen von 15.000.000 Grad); Minami: Kaka Jūmanokushi Daisōjin (beschwört verkohlte Überreste von Ryūjin Jakkas Opfern, um Feinde psychologisch zu überwältigen); und Kita: Tenchi Kaijin (entfesselt einen konzentrierten Schlag, der Ziele zu Asche reduziert). Neben seinem Zanpakutō beherrscht er Hakuda, verwendet Techniken wie Ikkotsu (ein einzelner Schlag, der Wonderweiss' Abdomen vernichtet) und Sōkotsu (ein beidhändiger Schlag). Er ist auch in Flash Step und Kidō versiert. Wichtige Ereignisse später in seiner Amtszeit umfassen die Aufsicht über die Gotei 13 während des "Turn Back the Pendulum"-Arcs (110 Jahre zuvor), die Einleitung von Kisuke Uraharas Captain-Beförderung und die Handhabung von Verschwinden im Zusammenhang mit Hollowfication-Experimenten. Während Sōsuke Aizens Verrat opferte er seinen linken Arm, um Ittō Kasō auszuführen, sperrte Aizens Fraktion mit Jōkaku Enjō ein und kämpfte gegen Wonderweiss, gipfelnd in Ennetsu Jigoku. Im "Thousand-Year Blood War"-Arc exekutierte er nach Sasakibes Tod Driscoll mit Ryūjin Jakka für die Nutzung von Sasakibes gestohlenem Bankai. Gegen Yhwachs Doppelgänger Royd Lloyd aktivierte er sein volles Bankai, enthüllte alle vier Formen und tötete Royd. Der echte Yhwach erschien dann, nutzte Yamamotos emotionale Turbulenzen über gefallene Kameraden aus und spaltete ihn entzwei. Yhwach kritisierte Yamamotos Wandel von rücksichtslosem Pragmatismus zu ehrenhafter Zurückhaltung und vernichtete seine Überreste. Posthum erhielt Yamamoto den Beinamen "Gründer der Gotei", als er in die Hölle verbannt wurde.