Dr. Isaac Gilmore, geboren am 25. Januar 1938, ist Spezialist für Kybernetik. Als Holocaust-Überlebender, dessen Familie von Black Ghost getötet wurde – wie in einer Konfrontation mit deren Anführer Skull erwähnt – variieren sein Alter und seine ethnische Zugehörigkeit in verschiedenen Kontinuitäten. In der Anime-Serie von 2001 wird er als 63-jähriger dargestellt, während er in "God's War" 77 Jahre alt ist. Der Anime identifiziert ihn als russischen Juden, was mit Shotaro Ishinomoris Konzeptnotizen zu "God's War" übereinstimmt.

Er trat Black Ghost 1961 bei, nachdem eine gescheiterte künstliche Herzoperation in Moskau zum Tod eines Patienten führte. Professor Brown, ein vermeintlich toter Nobelpreisträger, rekrutierte ihn, indem er fortschrittliche Herzpläne vorzeigte und Gilmores Ambitionen für wissenschaftlichen Fortschritt ohne ethische Grenzen ansprach. Während seiner frühen Zeit half er dabei, Probanden in Cyborgs zu verwandeln, entwarf die Kybernetik für Françoise (003) und überwachte die Transformation von Ivan Whisky (001), wobei er wissenschaftliche Errungenschaften über Moral stellte und ethische Bedenken wie Dr. Whisky's Ausbeutung seines Säuglingssohnes ignorierte.

Jahrzehnte später brach eine moralische Krise während der Umwandlung von Geronimo Jr. (005) aus. Black Ghost bestand auf einem billigeren, minderwertigen künstlichen Herzen und wischte Gilmores Bedenken bezüglich des Überlebens des Patienten beiseite. Dies löste eine Halluzination seines jüngeren, arroganten Ichs aus, das sein neugefundenes Gewissen verspottete. Der Stress verursachte einen Herzinfarkt. Während seiner Genesung wurde er Zeuge der qualvollen Umwandlungen nachfolgender Cyborgs (006–008). Dies gipfelte in seinem Seitenwechsel; er verbündete sich mit 001, um kryogenisch gelagerte Cyborgs (001–004) zu befreien, und organisierte die Flucht der neu erschaffenen 005–009.

Nach seinem Seitenwechsel wurde Gilmore zur primären technischen Unterstützung und zum Mentor der Cyborgs, wartete ihre kybernetischen Systeme und bot strategische Anleitung während Missionen. Er äußerte offen Reue für seine Rolle bei ihrer Erschaffung und betrachtete seine Unterstützung als Sühne für die Ermöglichung von Black Ghosts Gräueltaten. Seine Beziehung zu der Gruppe entwickelte sich zu einer Art Ersatzfamilie, insbesondere mit Ivan (001), den er oft beschützte. In späteren Handlungssträngen wie "Call of Justice" half er den Cyborgs weiterhin gegen neue Bedrohungen, trotz ihrer öffentlichen Verteufelung.

Sein Titel wechselt zwischen "Doktor" und "Professor" in verschiedenen Übersetzungen, da der japanische Begriff "hakase" beide Interpretationen zulässt.

Dr. Gilmore