Akagi Honjō dient als Operator am Shinkansen-Ultra-Evolutionsinstitut, Zweigstelle Ōmiya, unterstützt Shinkalion-Einsätze und koordiniert die Aktivitäten der Zweigstelle. Er arbeitet eng mit den Kollegen Futaba Mihara, Daiya Oyama und Minori Sanjo zusammen und berichtet an die Vorgesetzten Shinpei Izumi und Hokuto Hayasugi. Später steigt er zum kommissarischen Leiter der Kyoto-Zweigstelle des Instituts auf und übernimmt größere Führungsverantwortung. Akagi ist entschlossen und leidenschaftlich, stellt sich Herausforderungen direkt und zeigt Mut, um andere zu schützen. Er zeigt starke Loyalität gegenüber seinem Team und der Mission, ein tiefes Verantwortungsbewusstsein und Vorsicht gegenüber potenziellen Sicherheitsbedrohungen. Sein operativer Stil betont die strikte Einhaltung von Regeln und Verfahren, sorgfältige Beachtung von Details und methodische Datenanalyse. In einer persönlichen Begegnung trifft er Futaba Mihara im Wissenschaftsmuseum von Ueno, ein locker gestaltetes Vordate-Treffen, das sich in Diskussionen über die menschliche Evolution entfaltet.