Professor Clay Fermin fungierte als leitender Wissenschaftler der Vexos, einer Organisation, die mit der vestalischen Königsfamilie verbunden war. Er war der Vater von Keith Fermin, bekannt als Spectra Phantom, und Mira Fermin, die die Bakugan Battle Brawlers Resistance anführte. Seine Forschung konzentrierte sich auf die Entwicklung fortschrittlicher Bakugan-Technologie und Waffen für die Vexos und König Zenoheld. Clay war der Pionier der Mechanischen Bakugan, synthetischer Versionen organischer Bakugan. Zu seinen ersten erfolgreichen Modellen gehörten Ventus Altair, getestet von Lync Volan, und Darkus Hades, zugewiesen an Shadow Prove. Spätere Upgrades umfassten Pyrus Farbros, Subterra Dryoid, Haos Boriates, Aquos Macubass, Darkus MAC Spider und Ventus Aluze, die entwickelt wurden, um Attributsenergie von den Sechs Alten Kriegern von Vestroia zu sammeln. Seine Waffenentwicklungen beinhalteten das Bakugan Termination System (BT-System), um organische Bakugan auf New Vestroia zu vernichten. Nachdem Drago das BT-System zerstört hatte, baute Clay auf Befehl von Zenoheld das Alternative Weapon System (AWS), eine Vorrichtung, die Planeten zerstören und sowohl die Erde als auch Vestal ins Visier nehmen konnte. Clay agierte als ein ehrgeiziger, moralisch strenger Wissenschaftler, der häufig die Forschung über familiäre Bindungen stellte. Er zeigte wenig Zuneigung zu seinen Kindern, teilte Mira kalt mit, dass Keith "nicht mehr existierte" und mied familiäre Gespräche. Dennoch schützte er gelegentlich ihre Sicherheit, etwa als er Mira vor Trümmern während des AWS-Einsturzes schützte. Er hegte eine tiefe Loyalität gegenüber Zenoheld, fürchtete berufliches Versagen, äußerte aber gelegentlich Misstrauen gegenüber Vexos-Mitgliedern wie Shadow Prove. Clay zeigte auch pragmatische Vorsicht, warnte Lync Volan vor den Konsequenzen für Verrat. Frühere Ereignisse prägten seinen Hintergrund: Eine Begegnung, in der er Miras Fragen zu Bakugan in seinem Labor abwies, veranlasste sie, sich dem Widerstand anzuschließen. Obwohl Keiths Verwandlung in Spectra Phantom unter unklaren Umständen stattfand, half Clay später Spectra, indem er Helios zu Cyber Helios und Cyborg Helios aufrüstete. Er beschaffte Spectra auch Mechanische Bakugan, die für Prinz Hydron bestimmt waren. Während des Konflikts zwischen den Vexos und dem Widerstand installierte Clay das Vexos Trap Field in der Motherpalace-Arena, um die Kraft organischer Bakugan im Kampf zu absorbieren. Er lehnte Spectras Angebot ab, zu desertieren, und entschied sich, Zenoheld zu dienen. Nach der Fertigstellung des AWS fing er Brawler in einer virtuellen Welt ein, um das System zu testen. In seinen letzten Momenten während des AWS-Einsturzes stieß Mira vor herabfallenden Trümmern weg, wurde jedoch selbst eingeschlossen. Er lehnte die Rettung durch Keith und Mira ab, ging weg und entschuldigte sich bei Mira. Seine letzte Handlung bestand darin, Aufnahmen des Gundalian-Neathian-Krieges zu betrachten, bevor er in der AWS-Explosion zusammen mit Zenoheld und Hydron starb. Spätere Serien bezogen sich auf Clay: In Bakugan: Gundalian Invaders wurde erwähnt, dass er die "Phantom Data"-Übertragung über den Gundalian-Neathian-Krieg empfing und analysierte. In Bakugan: Mechtanium Surge bemerkte Dan Kuso, dass Miras wissenschaftliche Karriere die Arbeit ihres Vaters widerspiegelte, und sie trug zur Entwicklung von Bakugan City bei.