Alan Smithee nutzt ein Pseudonym aus der Filmindustrie, das traditionell von Regisseuren verwendet wird, die sich von Projekten distanzieren. Seine wahre Identität verbindet ihn mit der Republik Gillanba, einer fiktiven Nation, die in einen Konflikt mit einem Nachbarstaat verwickelt ist.
Smithees Hauptmission ist der Erwerb eines seltenen Mineralerzes aus dem Königreich Vespania. Dieses Erz ermöglicht fortschrittliche Stealth-Technologie, die Smithee als Waffe einsetzen will, um die militärische Unterlegenheit Gillanbas auszugleichen. Er geht eine Partnerschaft mit Luciano Carnevale ein, dem Alias des italienischen Mafia-Mitglieds Salvatore Lucania, der gestohlene Erzproben besitzt.
Um Lupin III.s Kooperation zu sichern, entführt Smithee Fujiko Mine und stattet sie mit einem Sprengkragen aus, um Lupin zu hochriskanten Diebstählen als Fähigkeitstests zu zwingen. Ein anfänglicher Diamantenraub dient als Demonstration, während das wahre Ziel der "Cherry Sapphire" ist, der sich später als aus dem vespanischen Erz bestehend herausstellt.
Während des Austauschs auf dem Flughafen Haneda – wo Carnevale das Erz liefert und Smithee die Zahlung bereitstellt – erscheint Smithee mit schwer bewaffneten Verstärkungen. Als Lupins Gefährten Jigen und Goemon, verkleidet als Makler und Juwelenbesitzer, ihre Falle gemeinsam mit Conan und der Polizei auslösen, nutzt Smithee das Chaos, um Conan als Geisel zu nehmen. Er versucht, mit Carnevale und dem Erz per Flugzeug zu entkommen.
An Bord des Flugzeugs kommt es zur Konfrontation zwischen Smithee, Lupin und Conan. Carnevale greift mit einer Minigun ein, beschädigt die Cockpitsteuerung und die Hülle und verletzt Smithee tödlich. Eine anschließende Druckabfall in der Hülle schleudert Carnevale tödlich hinaus. Smithee erliegt seinen Verletzungen, bevor das Flugzeug abstürzt. Militärjets zerstören die fallenden Erzproben, wodurch Vespanias Ziel erreicht wird, seine Waffenfähigkeit zu verhindern.