Clint Barton dient als S.H.I.E.L.D.-Agent unter dem Kommando von Direktor Nick Fury. Fury schickt ihn zusammen mit der Agentin Natasha Romanoff aus, um den flüchtigen Tony Stark nach einem Vorfall mit War Machine und einem neuen Feind festzunehmen. In Karachi konfrontiert Barton Stark mit seinen charakteristischen Bogenfähigkeiten und Trickpfeilen. Der Punisher greift ein, um Starks Flucht zu ermöglichen, und zwingt Barton und Romanoff zum Rückzug. Später beteiligt sich Barton an der Verteidigung des kompromittierten S.H.I.E.L.D.-Helicarriers gegen die techno-organische Waffe Technovore und kämpft an Bord des Schiffes neben anderen Helden. Nach der Niederlage von Technovore und Ezekiel Stane wird Barton Zeuge, wie Stane in S.H.I.E.L.D.-Gewahrsam genommen wird.