MODOK dient als wiederkehrender Antagonist. Anfangs verbündet er sich mit Loki während des Ausbruchs aus dem Raft-Gefängnis, wird jedoch am häufigsten in DISK-Form vom Schurken Tim Gilliam beschworen. Nach Lokis Niederlage wird seine DISK von den Avengers gesichert, nur um von Mystique auf Befehl von Red Skull gestohlen zu werden, was dazu führt, dass MODOK sich den Masters of Evil als beständige Bedrohung innerhalb des Bündnisses anschließt.

Er behält sein charakteristisches Aussehen: ein großköpfiger, technologisch aufgerüsteter Organismus, der für die Fortbewegung einen Schwebestuhl benötigt. Seine primären Fähigkeiten sind sein immenser Intellekt und seine starken psionischen Kräfte, die er für strategische Angriffe und technologische Manipulationen gegen Helden und ihre jungen Verbündeten einsetzt.

MODOK ist an Schlüsselkonflikten beteiligt, darunter eine frühe Schlacht, in der er Loki dabei hilft, Avengers in DISKs gefangen zu nehmen. Später konfrontiert er direkt die Kinder, die DISKs führen, und ihre Superhelden-Partner, wie etwa den Angriff auf Akira Akatsuki und den Versuch, den kritischen Biocode Installer zu zerstören. Seine technologische Expertise wird von Verbündeten für Aufgaben wie die Überwindung von Stark-Industries-Systemen oder die Störung der Kommunikation der Helden genutzt.

Seine Präsenz bleibt durchweg antagonistisch, wobei er als hochrangige Bedrohung gilt, die koordinierte Anstrengungen der Helden erfordert. Innerhalb der Serie wird keine umfassende persönliche Hintergrundgeschichte, Charakterentwicklung oder Motivation jenseits seiner Rolle als Waffe der Masters of Evil behandelt. Nach seinem Beitritt zu ihnen setzt er seine Missionen unter der Leitung von Red Skull fort und bringt seinen Intellekt und seine psionischen Fähigkeiten in die Ziele der Gruppe ein, ohne nennenswerte Abweichungen in Loyalität oder Persönlichkeit.