Yagyū besucht die Hanzō National Academy als Erstklässlerin und wird trotz ihrer Jugend als Wunderkind in den Shinobi-Künsten gefeiert. Ihr prägendes Trauma ist der Tod ihrer jüngeren Schwester Nozomi, die kurz nach Yagyūs Einschulung an den Folgen eines Autounfalls starb. Als ständige Erinnerung trägt sie eine Augenklappe aus einem von Nozomis Bändern über ihrem funktionsfähigen rechten Auge. Dieser Verlust formte ihre anfangs distanzierte und einsame Natur, was sie dazu brachte, sich nur auf sich selbst zu verlassen und emotionale Bindungen zu meiden.
Ihre Entwicklung beginnt, als sie Hibari trifft, eine Klassenkameradin, deren verblüffende Ähnlichkeit mit Nozomi Yagyū tief bewegt. Sie nimmt eine streng beschützende große-Schwester-Rolle gegenüber Hibari ein und bildet eine intensive Bindung, die Yagyū langsam für andere öffnet. Diese Beziehung treibt ihr Charakterwachstum an und zwingt sie, Hibaris Sicherheit und emotionales Wohlbefinden über alles andere zu stellen, ohne Zögern zu ihrer Hilfe zu eilen. Doch diese Beschützerinstinkte können dazu führen, dass Yagyū Hibaris Fähigkeiten unterschätzt oder mit anderen in Konflikt gerät, die mit Hibari interagieren.
In der *Shinovi Versus*-Handlung wird Yagyūs Hingabe auf die Probe gestellt, als harte Trainingsbemerkungen Hibari an ihrem Geburtstag zur Flucht veranlassen. Yagyū sucht verzweifelt nach ihr und kämpft gegen Gegner wie Katsuragi, Ryōbi, Yozakura, Minori und Haruka, die ihren Weg blockieren oder ihren Beschützerinstinkt provozieren. Jeder Kampf stärkt ihren Entschluss zur Versöhnung. Sie findet Hibari wieder und schenkt ihr jede erdenkliche Sorte von Mr. Bunny-Bonbons als Friedensangebot. Trotz anhaltender Spannungen mit Rivalinnen wie Haruka lernt Yagyū, ihre Aggression zu zügeln, um Hibaris Wunsch nach einer konfliktfreien Feier zu respektieren.
Der Spin-off *Bon Appétit!* enthüllt weitere Motivationen. Yagyū nimmt an einem Kochwettbewerb mit Hibari teil, nachdem sie erfährt, dass der Hauptpreis ein Wunscherfüllungs-Spruchrolle ist. Ihr ursprünglicher Plan ist es, die Rolle zu nutzen, um ihre Bindung zu stärken. Während des Turniers nimmt sie zeitweise eine "große Schwester"-Rolle gegenüber Mitstreiterinnen wie Asuka und Daidōji ein. Nachdem sie Hibari im Finale besiegt, erkennt sie, dass ihre Bindung sich durch die gemeinsame Erfahrung natürlich vertieft hat, und zerstört die Rolle, womit sie bestätigt, dass ihre Verbindung keine übernatürliche Hilfe braucht.
Äußerlich hat Yagyū langes weißes Haar in Zöpfen mit Shuriken-Accessoires, rote Augen und ist 158 cm groß. Ihre Standardkleidung umfasst einen geschlitzten Ölpapier-Regenschirm, den sie im Kampf offensiv und defensiv einsetzt, einen schwarzen Mantel mit dreieckigem Besatz und einen rot karierten Rock. Ihr Schutztier ist ein Tintenfisch, was sich in ihrer Vorliebe zeigt, ganze getrocknete Tintenfische ohne Besteck zu essen.
Bemerkenswerte Eigenschaften sind gelegentliche Nasenbluten, wenn sie verlegen ist – oft durch Gespräche über Hibari – und Heuschnupfen-bedingte Schwächen. Sensorische Beeinträchtigungen während Heuschnupfen-Attacken verstärken ihre Abhängigkeit von Hibaris Anwesenheit. Sie hat auch Angst vor Achterbahnen, was ihre sonst stoische Fassung durcheinanderbringt.
Ihr Kampfstil betont Präzision und Ausweichen, nutzt Expertise im Verbergen ihrer Präsenz und manipuliert ihren Schirm, um Wirbelstürme zu erzeugen oder Angriffe zu blockieren. Diese Fähigkeiten, kombiniert mit taktischer Anpassungsfähigkeit, ermöglichen es ihr, höherrangige Gegner zu besiegen, trotz ihres Anfängerstatus.