Shinobu Yuuki ist ein jugendlicher Mensch aus einem namenlosen Dorf. Klein gewachsen mit kurzen schwarzen Haaren, wirkt sie oft reserviert und verdeckt zunächst ihr Gesicht mit ihrer Kapuze, wenn man sich ihr nähert. Nach ihrem Umzug nach New Tokyo trägt sie eine modifizierte Maid-Kimono-Uniform, während sie in der Fairyland Hall arbeitet. Ihre Persönlichkeit vereint Widerstandsfähigkeit mit Verletzlichkeit. Von Dorfkindern gemobbt, weil sie davon träumt, das Dorf zu verlassen und den Hauptstadtturm Amanomihashira zu erklimmen, lehnt sie zunächst Hilfe ab, obwohl Tränen ihre Verzweiflung verraten. Die Begegnung mit Touta Konoe, der denselben Traum teilt, lässt sie allmählich aufblühen. Sie entwickelt Zuneigung zu ihm, nennt ihn „großer Boss-Bruder“ und später „Sir“, was ihre Loyalität und Bewunderung zeigt. Ihre emotionale Tiefe wird deutlich, als sie nach einem Sturz auf Touta landet und vor Verlegenheit deutlich errötet. Inspiriert von einer Pilotin, die sie einst kannte, ist Shinobus größter Wunsch, am Wochenlangen Großen Solarrennen der Neo-Olympics teilzunehmen – ein Traum, der sie antreibt, das Dorf zu verlassen. Sie zeigt praktische Fähigkeiten als Mechanikerin, die sie von einer namenlosen Freundin erlernte, und nutzt diese, um ein Motorrad zu reparieren, das für ihre frühen Begegnungen mit Touta entscheidend ist. Ihre Geschichte beginnt, als Touta sie vor ihren Mobbern beschützt und ihren gemeinsamen Traum enthüllt. Sie verbinden sich weiter, als Touta versucht zu singen – seine Stimme klingt für Shinobu „engelsgleich“, obwohl andere ihn verspotten. Ein entscheidender Moment tritt ein, als ein Kind das reparierte Motorrad stiehlt und Shinobu über eine Klippe schleudert. Touta rettet sie, und ihr Überleben – dank seiner Unsterblichkeit – besiegelt ihren gegenseitigen Respekt und ein Versprechen, sich an der Turmspitze wiederzusehen. Später reist Shinobu nach New Tokyo, um Touta am Bahnhof und in der Fairyland Hall zu suchen. Ein Missverständnis bei ihrer Ankunft führt dazu, dass sie als Eindringling gilt, was durch Toutas Eingreifen geklärt wird. Sie tritt offiziell dem Personal der Fairyland Hall bei und integriert sich in die Umgebung der UQ Holder. Ihre Verbindung zu Touta vertieft sich durch einen Pactio-Vertrag, der ihr ein Artefakt schenkt: ein fliegendes Fahrrad. Diese Bindung spielt eine strategische Rolle während des Ba'al-Aufstands-Arcs, in dem sie an Missionen mit den UQ-Holder-Mitgliedern teilnimmt. Nach einem 47-jährigen Zeitsprung, während Touta als Weltenbaum gefangen ist, wird ihre Pactio-Karte leer. Das Epilog enthüllt, dass sie durch Planeten reiste und schließlich als Regierungswissenschaftlerin auf einer Welt namens „Planet Shinobu“ siedelte. Sie überlebt, ohne wesentlich zu altern, bis sie sich mit Touta wiedervereint. Die Handlung deutet an, dass sie später eines natürlichen Todes stirbt.