Jōgorō Kobato ist der männliche Protagonist der Serie und ein Oberschüler, der über einen bemerkenswert scharfen und deduktiven Verstand verfügt. Sein prägendstes Merkmal ist sein starker Drang, Rätsel zu lösen, einen Zwang, den er selbst als seine Fuchssseite bezeichnet. Dieser innere Antrieb zieht ihn ständig zu Rätseln und ungeklärten Ereignissen hin und erzeugt einen inneren Konflikt in ihm.

Kobatos Hintergrund ist geprägt von einer schmerzhaften Erfahrung während seiner Mittelschulzeit, als er die Rolle des großen Detektivs aktiv annahm. Er löste eifrig Probleme und Vorfälle in seiner Umgebung und genoss zunächst die Anerkennung und Aufmerksamkeit, die ihm dies einbrachte. Dieses Verhalten führte jedoch schließlich zu Groll und Feindseligkeit von anderen, gipfelnd in einem tief vernarbenden Vorfall, bei dem er einen anonymen Zettel erhielt, der ihn aufforderte, allein zu kommen. Dieses Trauma überzeugte ihn davon, dass Hervorstechen aufgrund seiner Weisheit nur Ärger und Isolation bringt.

Infolgedessen beginnt Kobato die Oberschule mit einer starken neuen Motivation: ein gewöhnlicher Bürger, oder Shoshimin, zu werden und ein ruhiges, friedliches und ereignisloses Leben zu führen. Er versucht, seine detektivischen Instinkte zu unterdrücken und sich in den Hintergrund einzufügen, wobei er ein höfliches und etwas gleichgültiges Auftreten pflegt, um keine Aufmerksamkeit zu erregen. Obwohl er klug und gelegentlich zynisch ist, bemüht er sich bewusst, neutral zu handeln, und vergisst mit bemerkenswerter Häufigkeit die Namen von Personen – eine Angewohnheit, die ihm hilft, Distanz zu sozialen Verstrickungen zu wahren. Sein Aussehen wird als sanft und gutaussehend beschrieben, was sein Ziel, nicht aufzufallen, unterstützt.

Trotz seiner besten Bemühungen fällt es Kobato nahezu unmöglich, einem Rätsel zu widerstehen, wenn sich eines bietet. Seine scharfen Beobachtungsfähigkeiten und logischen Schlussfolgerungen führen ihn häufig dazu, die Wahrheit hinter den alltäglichen Vorfällen aufzudecken, die sein Schulleben plagen. Eine seiner bemerkenswerten Deduktionsmethoden besteht darin, seinen Fokus zu lockern, wenn er einer Antwort nahe ist, und einen Schritt zurückzutreten, um das Problem aus einer externen Perspektive zu betrachten und die Lösung zu finden. Wenn er das Schlüsselelement eines Rätsels identifiziert, verkündet er seine Erkenntnis bekanntermaßen mit einem charakteristischen Satz.

Seine bedeutendste Beziehung ist die zu seiner Mitschülerin Yuki Osanai. Da sie ihr gemeinsames Verlangen nach einem gewöhnlichen Leben erkennen und die wahren, potenziell problematischen Naturen des jeweils anderen verstehen, gehen sie ab dem Sommer ihres dritten Mittelschuljahres eine gegenseitig vorteilhafte oder reziproke Beziehung ein. Dieser Pakt basiert darauf, das Ziel des jeweils anderen nach einem friedlichen Dasein zu unterstützen, auch wenn ihre jeweiligen Persönlichkeiten sie häufig in chaotische Situationen verwickeln.

Kobato stammt aus einer Familie, die einen traditionellen japanischen Süßwarenladen betreibt, was ihn ironischerweise etwas müde von japanischen Süßigkeiten gemacht hat. Er entwickelt jedoch eine echte Vorliebe für westliche Süßigkeiten, insbesondere für den Charlotte-Kuchen aus einem Laden namens Jeff Beck, den er während seines zweiten Oberschuljahres genießt.