John D. Kunugi ist ein Mitglied von Spitzbergen, einer Organisation, die sich gegen kybernetische Verbesserungen namens Extensions ausspricht. Trotz dieser Mitgliedschaft arbeitet er heimlich mit der Berühren Corporation zusammen, da die terroristischen Aktivitäten von Spitzbergen die öffentliche Nachfrage nach Berührens Extension-Technologie steigern und deren Gewinne erhöhen.

Äußerlich hat Kunugi kurze blonde Haare, die oft seine blauen Augen und Gesichtsnarben verdecken, und er trägt einen markanten weißen Mantel. Er agiert als Kämpfer mit einer Nadelpistole, die in der Lage ist, die Bewegungen eines Gegners einzuschränken oder deren Kraft zu steigern, selbst bei nicht-extensionierten Personen. Während einer Auseinandersetzung mit Juzo Inui bemerkt Kunugi die Schwierigkeit, einem über-extensionierten Gegner gegenüberzustehen, und zielt strategisch auf Verbündete ab, um sich Vorteile zu verschaffen.

Kunugi fängt Tetsuro Arahabaki und übergibt ihn an Andy Wachowski, den Repräsentanten von Spitzbergen. Wachowski lässt Tetsuro später im Rahmen eines Deals frei, um das Harmony-Gerät gegen Berühren einzusetzen. Kunugi äußert Skepsis gegenüber Wachowskis Führung, insbesondere in Bezug auf Victor Steinbergs Aufnahme in Spitzbergen. Er sieht Victors Beteiligung als Fehler an, da Victor eng mit der Entwicklung von Extensions verbunden ist – genau der Technologie, die Spitzbergen auslöschen will. Kunugi stellt auch infrage, ob Wachowski neben der erklärten Mission noch weitere Ziele verfolgt.

Seine Verbundenheit zu Berühren kommt während des Konflikts mit Juzo ans Licht. Kunugi enthüllt, dass er von Hugh Cunningham, einem Berühren-Manager, unterstützt wird, und erklärt, dass terroristische Akte die Marktnachfrage nach Extensions schaffen. Kunugis Rolle beinhaltet, Juzo aufzuhalten, um dem Berühren-Agenten Pepper ein Attentat auf Wachowski zu ermöglichen. Als das Attentat scheitert, versucht Kunugi zu fliehen, trifft jedoch auf Cronen von Wolf, einen ehemaligen Trainingskameraden. Nach einem kurzen Gefecht nutzt Kunugi eine Ablenkung durch den Kampf zwischen Juzo und Seven, um vom Schauplatz zu fliehen.