Conan Edogawa ist die öffentliche Identität von Shinichi Kudo, einem brillanten Highschool-Detektiv, dessen Leben durch eine zufällige Begegnung mit zwei Männern in schwarzen Anzügen in einem tropischen Freizeitpark unwiderruflich verändert wurde. Um ihn als Zeugen zu beseitigen, zwangsernährten sie ihn mit einem experimentellen Gift namens APTX 4869. Anstatt ihn zu töten, löste die Droge eine seltene Nebenwirkung aus, die seinen gesamten Körper auf die Größe eines kleinen Kindes, etwa sechs oder sieben Jahre alt, schrumpfte. Diese Verwandlung zwingt Shinichi, sein früheres Leben aufzugeben. Um seine Identität zu schützen und seine Lieben vor der mysteriösen und gefährlichen Schwarzen Organisation, die das Gift herstellte, zu bewahren, nimmt er das Pseudonym Conan Edogawa an. Der Name selbst ist eine Hommage an die Kriminalliteratur, indem er die Namen der berühmten Autoren Arthur Conan Doyle und Edogawa Ranpo kombiniert.

In seiner neuen Form zieht Conan in das Haus seiner Kindheitsfreundin Ran Mouri und ihres Vaters, des Privatdetektivs Kogoro Mouri. Ran hat keine Ahnung, dass das bei ihr lebende Kind tatsächlich Shinichi ist, und Conan arbeitet unermüdlich daran, diese Fassade aufrechtzuerhalten. Seine Persönlichkeit ist durch diese Dualität geprägt. Äußerlich muss er sich wie ein typischer Erstklässler verhalten, Ran als Ran-neechan ansprechen und kindische Ausrufe wie Ah-le-le? verwenden, um Unschuld vorzutäuschen. Innerlich behält er jedoch den scharfen Verstand, den reifen Zynismus und die deduktive Brillanz eines erstklassigen Teenager-Detektivs. Dies führt oft zu Aussetzern, bei denen er eine komplexe Schlussfolgerung äußert oder fortgeschrittenes Wissen demonstriert, was ihn zwingt, schnell seine Spuren zu verwischen, indem er behauptet, es im Fernsehen oder von Kogoro selbst gelernt zu haben.

Conans Hauptmotivation ist zweigeteilt und treibt fast jede seiner Handlungen an. Das unmittelbarste Ziel ist es, ein dauerhaftes Gegenmittel zu finden, um in seinen ursprünglichen Körper zurückzukehren, eine Suche, die greifbarer wird, nachdem er sich mit Ai Haibara anfreundet, einer ehemaligen Wissenschaftlerin der Schwarzen Organisation, die die Droge herstellte. Sein übergeordnetes und gefährlicheres Motiv ist es, die Schwarze Organisation aufzuspüren und zu zerschlagen, das Syndikat, das ihn vergiftet hat. Seine Rolle in der Geschichte ist die eines geheimen Beschützers. Er nutzt seine Fähigkeiten, um eine ständige Flut komplexer Mordfälle zu lösen, wobei er Kogoro oft mit einem Betäubungspfeil außer Gefecht setzt und eine stimmverändernde Fliege verwendet, um ihn zu imitieren, wodurch der legendäre Ruf des schlafenden Kogoro entsteht. Dies verschafft ihm Zugang zu polizeilichen Ermittlungen und Medienberichterstattung, von denen er hofft, dass sie schließlich zu einem Hinweis auf seine Feinde führen.

Conans wichtigste Beziehungen sind der emotionale Kern seines verborgenen Lebens. Seine Beziehung zu Ran Mouri ist die ergreifendste; er wacht ständig über sie, kann aber seine wahren Gefühle oder seine Identität nicht preisgeben, was zu vielen peinlichen und schmerzhaften Situationen führt. Mit Kogoro Mouri verbindet Conan eine transaktionale, aber sich vertiefende Bindung; Kogoro sieht ihn als lästig an, hat aber den Jungen wirklich ins Herz geschlossen, während Conan ihn als Werkzeug für seine Ermittlungen benutzt. Professor Hiroshi Agasa ist sein vertrauenswürdigster Vertrauter und Wohltäter, der als eine Art Ersatzgroßvater fungiert, der nicht nur sein Geheimnis kennt, sondern auch die genialen Gadgets entwirft, auf die Conan angewiesen ist. Ai Haibara ist eine einzigartige Verbündete, ein weiteres Opfer von APTX 4869, das seine Lage vollkommen versteht, und ihre Beziehung entwickelt sich von gegenseitigem Misstrauen zu einer tiefen, auf Vertrauen basierenden Partnerschaft, die gegen die Schwarze Organisation vereint ist. Er navigiert auch durch das Leben als Mitglied der Detective Boys, einer Gruppe echter Grundschulklassenkameraden, die zu seiner überraschenden Kompetenz aufschauen, auch wenn er ihre Possen oft als ermüdend empfindet.

Im Laufe seiner Reise zeigt Conan eine deutliche Entwicklung. Anfangs impulsiv und zu rücksichtslosen Alleingängen neigend, die ihn in Gefahr bringen, lernt er größere Vorsicht und den Wert der Zusammenarbeit, da er mehr erwachsene Verbündete wie das FBI und seinen Vater Yusaku Kudo gewinnt. Während sein grundlegender Gerechtigkeitssinn und seine Ungeduld gegenüber dem Bösen bestehen bleiben, verbessert sich seine Fähigkeit, die Kinderrolle aufrechtzuerhalten, obwohl seine angeborene Neugier und Leidenschaft für die Wahrheit immer noch zu häufigen Beinahe-Unfällen führen.

Um den Mangel an Kraft seines geschrumpften Körpers auszugleichen, setzt Conan ein Arsenal bemerkenswerter Gadgets ein, die von Professor Agasa erfunden wurden. Dazu gehören seine charakteristische stimmverändernde Fliege, kraftverstärkende Tret-Schuhe, die es ihm ermöglichen, jedes Objekt, typischerweise einen Fußball, mit unglaublicher Wucht fliegen zu lassen, ein solarbetriebenes Turbo-Skateboard für Hochgeschwindigkeitsverfolgungen und eine Betäubungspfeil-Uhr. Über seine Gadgets hinaus sind seine größten Fähigkeiten seine eigenen. Er verfügt über einen genialen Intellekt mit einem scheinbar fotografischen Gedächtnis für Details, das es ihm ermöglicht, sich an jede Facette eines Falles zu erinnern. Er ist ein Meister des deduktiven Denkens, der Beobachtung und besitzt ein umfangreiches, vielseitiges Wissen über Trivia von Wissenschaft bis Literatur. Er ist ein außergewöhnlich begabter Athlet, insbesondere im Fußball, und hat Kenntnisse in allem vom Fliegen eines Hubschraubers bis zum Skifahren bewiesen. Seine einzigen nennenswerten Schwächen sind eine berüchtigt schlechte Singstimme und ein Mangel an Koordination bei Aktivitäten wie Baseball.