Conan Edogawa ist das Pseudonym von Shinichi Kudo, nachdem ihn Mitglieder der Black Organization während einer Ermittlung im Tropical Land mit der experimentellen Droge APTX 4869 vergiftet und in ein Kind verwandelt haben. Um sich und andere vor der Organisation zu schützen, nimmt er diese neue Identität an, die sich aus den Namen der Krimiautoren Arthur Conan Doyle und Edogawa Ranpo zusammensetzt. Er lebt mit seiner Jugendfreundin Ran Mouri und deren Vater Kogoro Mouri zusammen und nutzt deren Verbindung zu Kogoros Detektei, um Fälle zu finden, die möglicherweise mit der Black Organization in Verbindung stehen.
Obwohl er körperlich ein Kind ist, behält Conan seinen jugendlichen Intellekt, seine Erinnerungen und seine deduktiven Fähigkeiten. Er besucht die Teitan-Grundschule und gründet mit seinen Klassenkameraden Ayumi Yoshida, Mitsuhiko Tsuburaya und Genta Kojima die Detektivjungen. Anfangs von ihren Streichen genervt, entwickelt er allmählich Kameradschaft und weist ihnen Ermittlungsaufgaben zu. Um Fälle diskret zu lösen, verwendet er Gadgets, die von Professor Agasa erfunden wurden, wie einen Pfeil mit Beruhigungsmittel in seiner Armbanduhr, um Kogoro zu sedieren, und eine sprechende Krawatte, um Kogoros Stimme bei Deduktionen nachzuahmen, was die Figur des „schlafenden Kogoro“ entstehen lässt. Gelegentlich nutzt er Sonoko Suzuki als Stellvertreterin für Deduktionen, wenn Ran oder Sonoko involviert sind.
Conan bewahrt eine kindliche Fassade, nennt Ran „Ran-neechan“ und bezeichnet sein ursprüngliches Ich als „Shinichi-niichan“. Er verwendet oft einfache Sprache gegenüber Erwachsenen, verrät aber manchmal unbeabsichtigt fortgeschrittenes Wissen während der Fälle, das er dann auf Fernsehen, Kogoro, Professor Agasa oder Shinichi zurückführt. Mit einem starken Gerechtigkeitssinn ausgestattet, strebt er danach, Verbrecher zu fassen, und greift aktiv ein, um Täter davon abzuhalten, Selbstmord zu begehen, da er glaubt, dass ein Versagen in dieser Hinsicht einem Versagen als Detektiv gleichkommt. Diese Überzeugung rührt von einem Vorfall in der Vergangenheit her, bei dem er den Selbstmord eines Täters nicht verhindern konnte, was ihn bis heute belastet.
Er hat eine enge Beziehung zu der beschützenden Ran, die seine wahre Identität nicht kennt, was zu persönlichen Dilemmata führt. Seine ermittlerischen Fähigkeiten erregen den Verdacht einiger Strafverfolgungsbeamter, darunter FBI-Agenten und die Polizei von Nagano, obwohl die meisten nichts über seinen Hintergrund wissen. Er arbeitet mit Verbündeten wie dem FBI-Agenten Shuichi Akai und später Ai Haibara zusammen, einem ehemaligen Mitglied der Black Organization mit dem Codenamen Sherry, die ebenfalls durch APTX 4869 geschrumpft ist. Haibara liefert wichtige Informationen über die Organisation, einschließlich Warnungen davor, die Telefonnummer des Bosses zu untersuchen, die sie als „Pandoras Büchse“ bezeichnet.
Während der Ereignisse in „The Bride of Halloween“ untersucht Conan Bombenanschläge in Shibuya, die mit Halloween-Feierlichkeiten zusammenfallen. Dieser Fall steht in Verbindung mit einem früheren Vorfall, an dem Rei Furuya (auch bekannt als Toru Amuro) und seine Polizeiakademie-Kameraden – Hiromitsu Morofushi, Jinpei Matsuda, Kenji Hagiwara und Wataru Date – beteiligt waren, die zuvor einen Bombenanschlag von „Plamya“ vereitelt hatten. Als ein Serienbomber, der mit Matsudas Tod in Verbindung steht, aus dem Gefängnis entkommt, arbeitet Conan mit Furuya zusammen, um neue Anschläge zu untersuchen, von denen einer Kogoro und Haibara verletzt. Durch die Analyse von Mustern in den Straßenlayouts von Shibuya aus einem wiederhergestellten Dokument schließt Conan, dass Christine Richard die wahre Identität von „Plamya“ ist. Er greift ein, um Racheaktionen gegen sie durch Elenica Lavrentyeva, die Anführerin von „Nado Unichtozit“, zu verhindern, und koordiniert mit den Detektivjungen den Einsatz eines großen aufblasbaren Balls, der reaktive Chemikalien, die über Shibuya verteilt wurden, trennt und eine stadtweite Explosion verhindert.
Seine weiteren Aktivitäten umfassen die Konfrontation mit Mitgliedern der Black Organization in mehreren Handlungsbögen. Im Vermouth-Bogen deckt er die Beteiligung der Schauspielerin Sharon Vineyard auf. Während des Kir-Bogens hilft er dabei, die CIA-Agentin Hidemi Hondou unter dem Codenamen Kir als Spionin in der Organisation zu platzieren. Im Bourbon-Bogen identifiziert er Rei Furuya als einen Agenten des öffentlichen Sicherheitsdienstes, der sich in die Organisation eingeschleust hat, und entwickelt Strategien, um Haibara vor Bourbons Nachforschungen zu schützen. Derzeit verfolgt er im Rum-Bogen den Stellvertreter der Organisation anhand fragmentarischer Beschreibungen, die Haibara geliefert hat.
Körperlich verfügt Conan über Fähigkeiten im Fußball, obwohl seine kindliche Statur seine Kraft einschränkt. Er kompensiert dies mit kraftverstärkenden Kick-Schuhen, die von Professor Agasa erfunden wurden und es ihm ermöglichen, Verdächtige mit Projektilen zu überwältigen. Eine bemerkenswerte Schwäche ist seine Ton