Kogoro Mouri, ein Privatdetektiv, der in internationale Intrigen und kriminelle Ermittlungen verstrickt ist, ermittelt in einem hochkarätigen Fall während eines Festivals in einem Luxushotel, an dem Conan Edogawa und seine Tochter Ran teilnehmen. Als Rans auffällige Ähnlichkeit mit Prinzessin Mira von Vespania sie zu einem gefährlichen Doppelgänger-Dasein zwingt, verfolgt Kogoro die Verschwörung bis nach Vespania und arbeitet dabei mit Inspektor Megure und Interpols Koichi Zenigata zusammen. Offiziell in Zenigatas Taskforce eingebunden, die es auf Lupin III abgesehen hat, balanciert er zwischen Autorität und heimlicher Abhängigkeit von Conans anonymen Deduktionen.
Lupin III infiltriert später die Ermittlungen, indem er Kogoros Identität nachahmt—ein Schwindel, der auffliegt, als Zenigata subtile Verhaltensfehler bemerkt, darunter Lupins Verwendung eines Spitznamens, der nur in ihrer Rivalität existiert. Kogoros anfänglicher Unglaube an Lupins Existenz, den Dieb als manga-basierte Erfindung abtunend, steht im Kontrast zu seiner analytischen Untersuchung eines inszenierten königlichen Jagdunfalls, der Königin Sakura und Prinz Gill das Leben kostete. Trotz seiner Bemühungen werden seine Beiträge oft von Conans diskreten Interventionen überschattet.
Seine beschützenden Instinkte kommen zum Vorschein, wenn Ran in Gefahr gerät, was sein Engagement antreibt, selbst wenn seine Rolle darin besteht, Conan Zugang zu Tatorten oder diplomatischen Netzwerken zu verschaffen. Eine spätere Ermittlung im Hotel, bei der ein italienischer Popstar Todesdrohungen erhält, zeigt Kogoro anwesend, aber am Rande, was seine wiederkehrende Position als Beschützer und Handlungsvermittler unterstreicht. Obwohl er subtil von Conan geleitet wird, behält Kogoro die formelle Ermittlungsautorität und verankert ihre Partnerschaft in einer Dynamik unausgesprochener Zusammenarbeit.