Riki Naoe verlor beide Elternteile im Alter von etwa zehn Jahren, was zu Depressionen und einer gleichzeitigen Narkolepsie-Diagnose führte, die einen unkontrollierbaren Bewusstseinsverlust verursachte. Kyousuke Natsume lud ihn ein, den Little Busters beizutreten, einer Gruppe, die gegründet wurde, um „die Gerechtigkeit zu bewahren“ und „den Feind zu bekämpfen“, und half ihm so, aus seiner Depression herauszukommen und Freundschaft mit Rin Natsume, Masato Inohara und Kengo Miyazawa zu schließen. Körperlich weist Riki einen schwachen Körperbau und ein mädchenhaftes Aussehen auf, ist 166 cm groß und wiegt 54 kg, was ihn zum schwächsten ursprünglichen Mitglied macht. Dennoch zeigt er Geradlinigkeit, gesunden Menschenverstand, Mitgefühl und Verlässlichkeit und unterstützt oft Freunde in persönlichen Schwierigkeiten. Seine Narkolepsie tritt häufig auf, nachdem er sie erwähnt hat, was seinen Alltag beeinträchtigt und Möglichkeiten einschränkt.
Innerhalb der Little Busters fungiert Riki als eine einigende Figur und rekrutiert erfolgreich neue Mitglieder für ihr Baseballteam, wenn andere scheitern. Dies beinhaltet die Vertiefung von Bindungen zu weiblichen Klassenkameraden, indem er ihnen in persönlichen Krisen hilft, ihre Geschichten aufdeckt und ihr Vertrauen gewinnt. Seine Intelligenz und reflektierende Natur ermöglichen es ihm, philosophische Konzepte zu betrachten, einschließlich des „Geheimnisses der Welt“, das in mysteriösen Notizen erwähnt wird, die Rin erhält. In einer konstruierten Welt, die dazu dient, ihn und Rin zu stärken, durchlebt er wiederholte Zyklen, wobei seine Kampfstatistiken und Attribute mit jedem Durchlauf allmählich steigen und schließlich andere Mitglieder übertreffen. Während dieser Zyklen nimmt er manchmal Anomalien der Welt wahr, wie Zeitstopps oder unnatürliche Ereignisse, die von Kyousuke beeinflusst werden, obwohl die wahre Natur der Welt verborgen bleibt.
Im Refrain-Szenario reformiert Riki die Little Busters, nachdem Kyousukes harte Methoden Rin psychisch geschädigt haben. Er heilt Rins Trauma, deckt die persönlichen Kämpfe von Masato und Kengo auf und holt Kyousuke aus seiner Depression, wodurch die Gruppe wiedervereint wird. Dies enthüllt das „Geheimnis der Welt“: Die konstruierte Realität imitiert das Semester, das zu einem tödlichen Busunglück führt, geschaffen von Kyousuke und den anderen, um Riki und Rin zu helfen, die Kraft zu erlangen, mit der bevorstehenden Tragödie umzugehen. Als Riki von dem Unfall erfährt, beschließt er, alle zu schützen, und nutzt seine Intelligenz und Gelassenheit, um die Ereignisse in der realen Welt zu verändern. In späteren Zeitlinien wird er Rins Freund, wobei sich ihre Beziehung nach einem Heiratsantrag romantisch entwickelt. Ein zukünftiges Szenario zeigt ihn als Vater einer Tochter, Kaya Naoe, mit Kudryavka Noumi. Zu seinen körperlichen Fähigkeiten gehört der Wechsel in eine W-Sitzposition.
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