Shōko Makinohara manifestiert sich in zwei verschiedenen zeitlichen Zuständen: einmal als Mittelschülerin und einmal als ihre ältere Version aus der Zukunft. Die jüngere Shōko, etwa 13 Jahre alt und 1,50 m groß, hat langes schwarzes Haar mit Pony und hellblaue Augen. Sie trägt typischerweise eine weiße und blaue Mittelschuluniform mit blauem Rock und roter Schleife. Die ältere Shōko, etwa 18 Jahre alt und 1,58–1,60 m groß, hat ähnliche Gesichtszüge, wirkt aber reifer und ist oft in der braunen Weste/Sakko-Uniform der Minegahara High School mit roter Krawatte oder in einem weißen Kleid zu sehen, das später eine Operationsnarbe zwischen ihren Brüsten offenbart.
Shōko wurde mit einer schweren angeborenen Herzerkrankung geboren und musste bereits in der Grundschule häufig ins Krankenhaus. Dieser Zustand verhinderte, dass sie sich eine Zukunft vorstellen konnte, was sich zeigte, als sie eine Hausaufgabe in der vierten Klasse über ihre Lebenspläne nicht fertigstellen konnte, während ihre Klassenkameraden dies leicht schafften. Ihr schlechter Gesundheitszustand belastete ihre Eltern sehr, denen sie trotz ihrer Krankheit gefallen wollte.
Zwei Jahre vor den Hauptereignissen traf die ältere Shōko Sakuta Azusagawa am Shichirigahama-Strand, als dieser mit dem Adoleszenz-Syndrom seiner Schwester Kaede kämpfte. Während dieses Treffens teilte sie ihre Philosophie, dass „das Leben da ist, damit wir freundlicher werden“, und drückte ihr tägliches Ziel aus, ein wenig freundlicher zu sein als am Tag zuvor. Sie ermutigte Sakuta, diese Einstellung zu übernehmen, und merkte an, dass sein einzigartiges Verständnis von Schmerz ihn besonders mitfühlend machen könnte. Diese Begegnung machte sie zu Sakutas erster romantischen Interesse.
In der gegenwärtigen Zeitlinie traf die Mittelschul-Shōko Sakuta und Mai Sakurajima während eines Regenschauers, als sie eine ausgesetzte Katze mit ihrem Schirm beschützte. Nachdem Sakuta die Katze (namens Hayate) adoptiert hatte, besuchte sie regelmäßig seine Wohnung, um nach ihr zu sehen. Bei einem Krankenhausbesuch vertraute sie Sakuta ihre Herzerkrankung und die emotionale Belastung an, die sie für ihre Eltern darstellte.
Die ältere Shōko tauchte wieder auf, als Sakuta um Kaedes Gedächtnisverlust trauerte, und behandelte seine wiederaufgerissenen Brustnarben. Später enthüllte sie, dass diese Narben von einem Zeitparadoxon herrührten: Ihre Existenz hing von einer Herztransplantation von Sakuta ab, der in einem zukünftigen Verkehrsunfall am Heiligabend sterben würde. Als Sakuta beschloss, sich zu opfern, um sie zu retten, griff Mai ein und starb an seiner Stelle, wodurch sie zur Spenderin wurde. Dies schuf eine alternative Zeitlinie, in der Shōko mit Mais Herz überlebte, aber Sakuta, zutiefst erschüttert durch Mais Tod, nahm das Angebot der älteren Shōko an, in der Zeit zurückzureisen und den Unfall zu verhindern. Dieser Eingriff löschte Shōkos Überleben, da weder sie noch Sakuta starben, um die Transplantation zu ermöglichen.
Um das Paradoxon aufzulösen, schrieb Shōko bewusst ihre eigene Zeitlinie um. Sie kehrte in ihr Klassenzimmer der vierten Klasse zurück und vervollständigte die Hausaufgabe über Zukunftspläne, die sie zuvor leer gelassen hatte, und akzeptierte eine Realität, in der sie Sakuta und Mai nie begegnete. Diese Handlung löschte ihre Erinnerungen an sie, stellte aber ihr Überleben durch einen nicht näher bezeichneten Spender sicher, was durch Mais öffentliche Filmadaption ihrer Geschichte beeinflusst schien. In der neuen Zeitlinie erholte sich Shōko vollständig und traf Sakuta und Mai als gesundes Kind am Shichirigahama-Strand. Obwohl sie offiziell Fremde waren, führten fragmentarische Erinnerungen dazu, dass sich alle drei unbewusst wiedererkannten.
Ihre Persönlichkeit bleibt in allen Zeitlinien durchweg freundlich und idealistisch. Sie hilft freiwillig anderen, die unter dem Adoleszenz-Syndrom leiden, adoptiert ausgesetzte Tiere und priorisiert die Minimierung emotionaler Belastungen für ihre Familie. Theoretische Rahmen deuten darauf hin, dass ihre vielfältigen Manifestationen vom „Adoleszenz-Syndrom“ herrührten, das sie in drei Entitäten aufspaltete: eine, die in der Kindheit stagnierte, eine, die sich normal entwickelte, und eine, die ins Erwachsenenalter beschleunigte – obwohl dies spekulativ bleibt.
In späteren Jahren zog sie nach Okinawa und schickte Sakuta schließlich ein Foto ihrer gebräunten Selbst, das ihre fortschreitende Erholung und ihr neues Leben bestätigte.