Freeza tritt als Hauptantagonist in Super Dragon Ball Heroes auf, wobei sich sein Weg während des Kampfes auf Planet Namek vom ursprünglichen Zeitstrahl abspaltet. Ein von Towa geschaffener und durch die Zeit verstreuter Dark Dragon Ball verschmilzt mitten im Konflikt mit Son Goku mit ihm. Diese Fusion steigerte Freezas Kraft enorm, ermöglichte es ihm, den Super-Saiyajin Goku zu überwältigen, und zog das Eingreifen der Time Patrol nach sich, um den Zeitstrahl wiederherzustellen. Seine grundlegende Kraft und Transformationen stammen aus seiner mutanten Frieza-Rassen-Biologie, die ihm mehrere Formen zur Kraftunterdrückung und starke Regeneration verleiht. Der Dark Dragon Ball verstärkte diese angeborenen Eigenschaften und trieb seine Fähigkeiten über natürliche Grenzen hinaus. Er behält seine standardmäßige Formenabfolge (Erste, Zweite, Dritte, Finale, Volle Kraft, Goldenes Freeza), zeigt aber in Heroes auch Varianten wie die "Blue-Eye Golden Form", die weitere Kraftsteigerungen widerspiegeln. Als "Xeno Freeza" existiert er als eigenständige spielbare Charakterkarte, was seinen separaten Status im Multiversum des Spiels unterstreicht. Obwohl er von Figuren des Dämonenreichs wie Towa und Mechikabura manipuliert wird, verfolgt er primär seine eigenen Ziele der universellen Herrschaft und Rache an den Saiyajins, insbesondere Goku. Dies bringt ihn in direkten Konflikt mit der Time Patrol, einschließlich Avataren verschiedener Rassen und Xeno-Varianten der Haupthelden. Der entscheidende Wendepunkt liegt auf Namek. Während Freeza versucht, die Kraft des Dark Dragon Balls auszunutzen, wird er von den vereinten Kräften der Time Patrol und Xeno Trunks besiegt, wodurch der ursprüngliche Zeitstrahl wiederhergestellt wird. Dennoch bleibt er in späteren Handlungsbögen ein wiederkehrender Widersacher, der seine gesteigerte Kraft und Formen wie Goldenes Freeza gegen die Verteidiger der Zeitstrahle einsetzt.