Yamato Mikoto stammt aus dem Fernen Osten, wurde in ihrer Kindheit verwaist und in einem Waisenhaus aufgezogen, das von den Gottheiten Tsukuyomi und Takemikazuchi geleitet wurde. Sie trat der Takemikazuchi Familia bei, wo sie und andere Mitglieder häufig Sanjouno Haruhime aus ihrem Anwesen schmuggelten, um mit ihr zu spielen, was eine dauerhafte Freundschaft förderte, obwohl die Missbilligung ihres Vaters die Beziehungen des Schreins abbrach. Jahre später zog Mikoto mit der Familia nach Orario, um Geld für den Schrein zu sammeln, und erreichte Level 2 vor den Hauptereignissen. Mikoto hat langes schwarzes Haar, meistens zu einem Pferdeschwanz gebunden, bläulich-lila Augen und trägt einen violetten Kimono mit einem Sarashi darunter. Ihr Outfit umfasst einen dunkelroten Obi, knielange Stiefel, eine rote Schulterplatte an ihrem nicht bewaffneten Arm, Armschienen und einen Katana an ihrer Hüfte. Ihre Persönlichkeit vereint Ernsthaftigkeit, Ehre und Bescheidenheit. Sie verachtet hinterhältige Taktiken, wie etwa die Missbilligung von "Pass Parading"-Monstern auf Verbündete. Trotz ihrer Kampffähigkeiten weist sie Lob zurück und wird davon verlegen. Tief loyal und fürsorglich, priorisiert sie den Schutz ihrer Lieben und setzt bei Bedarf auch ninjutsu-basierte Tarnung gegen ihre direkte Art ein. Sie liebt heiße Quellen und hält sich an spezifische Baderituale. Als Level-2-Abenteurerin verfügt Mikoto über gesteigerte Kraft, Ausdauer, Beweglichkeit und Sinne, die normale Menschen übertreffen. Von Takemikazuchi ausgebildet, beherrscht sie mehrere Kampfkunststile und Waffen, darunter Katanas, Speere, Bögen, Äxte und Wurfwaffen wie Shuriken. Ihre Signature-Techniken umfassen "Mikazuchi", einen modifizierten Wurf in der Luft, und "Zekka", einen fortgeschrittenen Schnellzieh-Angriff, der mächtige Gegner wie das Monster Rex Amphisbaena verletzen kann. Sie praktiziert Concurrent Chanting, was Magie-Nutzung während der Bewegung ermöglicht. Ihre Magie, "Futsunomitama", manipuliert die Schwerkraft, um ein zermalmendes, kuppelförmiges Feld zu erschaffen, das gegen überlegene Gegner wirksam ist, wie etwa die kurzzeitige Immobilisierung des Level-5 Black Goliath. Ihre Skills sind "Yatanokurogarasu" zur Detektion von zuvor begegneten Monstern und "Yatanoshirogarasu" zum Aufspüren von Familia-Mitgliedern. Sie besitzt die Development Ability "Abnormal Resistance", um Gifte und ähnliche Effekte zu negieren. Ihre Ausrüstung umfasst Katanas wie "Kotetsu" und "Shunsan", geschmiedet von Welf Crozzo, und das Kurzschwert "Chizan", eines von einem Paar, das von Takemikazuchi geschenkt wurde. Mikotos Beziehungen prägen wichtige Handlungsstränge. Ihre lebenslange Bindung zu Haruhime treibt sie an, sich Bell Cranel bei der Rettung Haruhimes aus der Ishtar Familia anzuschließen, wobei sie selbstzerstörerischen Magie-Einsatz riskiert. Anfangs verehrte sie Takemikazuchi als Vaterfigur, doch ihre Gefühle vertieften sich zu romantischer Liebe. Sein Geschenk von "Chizan" – mit dem Versprechen des Zwillingsschwerts bei ihrer Rückkehr zur Familia – symbolisiert ihre Verbindung, wobei Mikoto plant, bei der Wiedervereinigung ihre Gefühle zu gestehen. Sie pflegt enge Bindungen zu ihren Kindheitsfreunden aus dem Waisenhaus, Kashima Ouka und Hitachi Chigusa, und kämpft trotz ihrer zeitweiligen Versetzung zur Hestia Familia nahtlos mit ihnen zusammen. Nachdem die "Pass Parade" ihrer Familia Bells Gruppe gefährdete, wechselte Mikoto zur Hestia Familia, um zu büßen und den Krieg gegen Apollo zu unterstützen. Obwohl als einjährige Vereinbarung gedacht, gewann sie Respekt für Bell und half seinen Bemühungen, einschließlich der Unterbringung der Xenos. Ihre Beziehung zu Hestia entwickelte sich von anfänglicher Feindseligkeit zu gegenseitigem Respekt, wobei Hestia ihr Kochen lobte und ihre romantischen Bestrebungen unterstützte. Ihre Charakterentwicklung dreht sich um die Versöhnung von Loyalitäten. Während sie sich den Bestrebungen der Hestia Familia widmet – dem Schutz Haruhimes und der Unterstützung Bells – plant sie, zur Takemikazuchi Familia zurückzukehren, um ihr Versprechen zu erfüllen. Diskussionen heben den praktischen Wert ihrer Fähigkeiten für die Hestia Familia hervor, erkennen aber auch ihre tieferen Bindungen und ungelösten Gefühle für Takemikazuchi an.