Dr. John H. Watson, ein pensionierter Kampfsanitäter, dessen Gesundheit während seines Einsatzes im Ersten Anglo-Afghanischen Krieg beeinträchtigt wurde, kehrte nach London zurück und suchte nach einer Unterkunft. Auf Anraten seines Freundes Stamford besuchte Watson die 221B Baker Street, um seinen potenziellen Mitbewohner Sherlock Holmes kennenzulernen. Dort fand er Holmes in einer Blutlache vor, die durch ein Experiment mit einem blutreaktiven Chemikalienagens entstanden war. Nachdem er bestätigt hatte, dass Holmes unverletzt war, stellte Watson fest, dass dieser seinen Hintergrund als Kriegssanitäter und Schriftsteller durch bloße Beobachtung schnell durchschaut hatte. Mit der Zustimmung der Vermieterin Ms. Hudson zog Watson ein.
Watson verfügt über ausgeprägte deduktive Fähigkeiten, die durch seine Erfahrungen an der Front geschärft wurden, und hält sich an einen strengen Moralkodex. Dies zeigt sich während ihres ersten Falls, als er seinen Dienstrevolver auf Holmes richtete, um ihn daran zu hindern, einen Verdächtigen namens Jefferson zu erschießen, der Informationen im Austausch für einen Gnadentod angeboten hatte. Holmes enthüllte, dass er nie vorhatte zu schießen, sondern Jefferson stattdessen der Polizei übergeben wollte. Watson dokumentiert Holmes’ Ermittlungen für das Strand Magazine unter dem Pseudonym „Conan Doyle“, wobei er Elemente aus narrativen Gründen fiktionalisiert, während er ihre gemeinsame Arbeit festhält.
Sein militärischer Hintergrund prägt seine praktische Denkweise und Gelassenheit während der Ermittlungen. Watson beteiligt sich aktiv an der Tatortuntersuchung, geht über die Bereitstellung medizinischer Expertise hinaus und liefert fundierte Perspektiven, die Holmes’ Deduktionen manchmal unterstützen. Ihre Dynamik entwickelt sich von anfänglichen Mitbewohnern zu vertrauten Partnern, wobei Watson sowohl als Mitarbeiter als auch als Biograf fungiert.