Whisper ist ein butlerartiger Yo-kai, der 190 Jahre lang gefangen gehalten wurde, bevor ein junger Junge ihn befreite. Nach seiner Befreiung schenkte Whisper dem Jungen eine besondere Uhr, die die Interaktion mit Yo-kais ermöglichte, und versprach ewigen Schutz vor übernatürlichen Bedrohungen, wodurch er zu seinem Führer und Beschützer wurde. Dreißig Jahre später, nachdem der ursprüngliche Träger erwachsen geworden war und die Fähigkeit zur Yo-kai-Wahrnehmung verloren hatte, wurde die Uhr versiegelt, um das Gleichgewicht zwischen den Welten zu bewahren. Whisper taucht während der Onimaro-Virus-Krise wieder auf, mit der Aufgabe, den nächsten auserwählten Uhrenträger zu identifizieren und auszubilden. Er findet Natsume Amano, die Tochter des ursprünglichen Protagonisten, und unterweist sie im Umgang mit der neu erworbenen Yo-kai Watch Arcane (auch Yo-kai Watch Elder genannt). Dieses Gerät ermöglicht es, Yo-kais zum Schutz vor Bedrohungen wie den Onimaro und ihren verwandelten menschlichen Wirten zu beschwören. Zu seinen Aufgaben gehören das Testen potenzieller Kandidaten auf Uhrenkompatibilität, das Erklären der Uhrmechanik und das Ermöglichen von Yo-kai-Beschwörungen. Während der Onimaro-Krise demonstriert er Natsume den Beschwörungsprozess mit einem Mitsumata Nozuchi Yo-kai. Whisper behält seine Identität als Yo-kai-Butler in beiden Zeitaltern bei und dient als Brücke zwischen menschlichen Trägern und der Yo-kai-Welt. Er existiert weiter, obwohl die ursprüngliche Uhr versiegelt wurde, was seine dauerhafte Funktion innerhalb der Yo-kai-Gesellschaft bestätigt.