Lysandre leitet Lysandre Labs und befehligt Team Flare. Öffentlich setzt er sich für friedliche Mega-Entwicklungs-Forschung zum weltweiten Wohl ein. Um Alain zu rekrutieren, besiegt er ihn im Kampf mit seinem Pyroar und bietet ihm anschließend einen Mega-Ring und Charizardit X unter der Bedingung von Alains Kooperation an. Alains Aufgaben umfassen das Sammeln von Mega-Stein-Daten und die Überwachung von Forschern wie Steven Stone. Lysandres Vergangenheit beinhaltete humanitäre Arbeit mit seinen Pokémon, bei der er gefährdete Bevölkerungsgruppen unterstützte. Doch die Begegnung mit Empfängern, die mehr Ressourcen forderten, säte Enttäuschung. Dies führte zu seiner Überzeugung, dass die angeborene Gier der Menschheit extreme Maßnahmen zu ihrer Erhaltung erfordert – eine Philosophie, die seine verdeckte Team Flare-Agenda antreibt. Während der Ereignisse von Mega Evolution Special IV überwacht Lysandre Alains Training im Labor und verlangt eine Serie von zehn aufeinanderfolgenden Kämpfen gegen Mega-Entwicklungs-Nutzer. Eine Niederlage in irgendeinem Kampf würde Alain seinen Key Stone und Mega Stone kosten. Lysandre zeigt sich Alain gegenüber charismatisch und ermutigend, lobt Siege und stellt Stärke als Schutz für andere dar. Gleichzeitig empfängt er Steven Stone und präsentiert den eingeschlossenen Giant Rock – einen mächtigen Megalith – unter dem Vorwand, eine weitere Krise wie in Hoenn zu verhindern. Lysandre zeigt sich als manipulativer Stratege. Er versichert Mairin, dass ihr Chespin, Chespie, nach einem Zusammenbruch durch den Kontakt mit einer mysteriösen grünen Lebensform während eines Laborunfalls behandelt wird. Öffentlich verspricht er Laborressourcen für Chespies Genesung und weist Alain an, Mega-Entwicklungs-Energie als mögliche Heilung zu sammeln. Insgeheim zweifelt seine Mitarbeiterin Malva seine Motive an und deutet auf nicht offengelegte Ziele im Zusammenhang mit Team Flare hin. Seine höfliche, aber kalkulierte Art zeigt sich auch gegenüber Professor Sycamore beim ersten Treffen. Lysandres Äußeres ist durchgängig: groß und schlank mit orangem Haar und Bart, gekleidet in einem schwarzen Anzug mit roter Futterung, fingerlosen Handschuhen und einem Mega-Ring. Sein Pyroar setzt Attacken wie Hyperstrahl und Einäschern ein. Die mysteriöse grüne Lebensform, der Chespie begegnet, wird zentral für Lysandres Forschung und verbindet sich mit Team Flares Interesse an Zygardes Macht. Die Beschreibung umfasst seine Rolle in den Mega Evolution Specials.