Shinobu Kobayashi ist die Kapitänin des Schwimmteams ihrer Akademie, mit rotem, halslangem Haar und braunen Augen. Sie gibt sich Lehrern gegenüber unschuldig, zeigt jedoch unbarmherzige Grausamkeit, wenn sie unbeaufsichtigt ist. Akademisch erfolgreich als Musterschülerin, hegt sie Arroganz und Neid, besonders gegenüber ihrer Schwimmteamkollegin Miyuki Nonogusa, nachdem diese sie bei einem Schulwettkampf ersetzt. Kobayashi wird ständig von ihrer untergebenen Mikimoto begleitet, die ihr bedingungslos gehorcht. Kobayashi und Mikimoto stellen Nonogusa im Umkleideraum, fesseln ihre Hände und Füße mit Klebeband und knebeln sie. Kobayashi misshandelt Nonogusa körperlich, befiehlt Mikimoto, sie mit einem Vibrator zu vergewaltigen, schneidet ihr Badeanzug mit einem Messer auf und fotografiert den Angriff mit einer Polaroid-Kamera für Erpressungszwecke. Mika Ito und ihr Freund schließen sich der Schikane an und steigern sie zu einer Orgie mit Nonogusa. Später fallen Kobayashi und Mikimoto einem Erregungszauber des Schülers Taki Minase während des Schwimmtrainings zum Opfer, der sie zu sexuellen Handlungen miteinander im Umkleideraum zwingt. Minase fotografiert sie für Erpressung. In einer Handlungsstrang rächt sich Kobayashi, nachdem Minase Nonogusa ausgenutzt hat, indem sie sich der Krankenschwester Reika Kitami anschließt, um Minase zu foltern. Kobayashi uriniert auf Minase, während Mikimoto ihm Oralverkehr leistet und Nonogusa ihn mit einem Vibrator angreift. Langanhaltende Folter kombiniert mit Aphrodisiakum-Injektionen führt zu Minases Tod durch Erschöpfung. Ein anderer Handlungsstrang zeigt, wie Minase Kobayashi im Kunstraum in die Falle lockt. Nachdem sie ihn beleidigt, bedroht er sie mit einer Weinflasche, die zuvor Lösungsmittel enthielt. Sie versucht zu fliehen, wird aber von einem anderen Schüler festgehalten, an einen Tisch gefesselt und mit der Flasche penetriert, bis sie vor Schmerz bewusstlos wird. Mikimoto und Nonogusa beleben sie später wieder. Im *Bible Black*-Universum nimmt Kobayashi während der Ereignisse des Spielsequels *Bible Black: The Infection* an einer Massenorgie im Schulkeller teil. Benommen und von Lust verzehrt, wird sie befreit, als Minase ihr ein Talisman in den Mund legt, den Zauber bricht und sie bewusstlos werden lässt. Sie wird neben anderen Opfern hospitalisiert. Ihre Rolle im Anime *Bible Black: Only* wiederholt ihre Beteiligung an Nonogusas Umkleideraum-Angriff und der darauffolgenden Orgie, konsistent mit ihrer Darstellung im Spiel.