Yamato Ishida, auch bekannt als Matt Ishida, ist ein DigiDestined, der mit Gabumon verbunden ist und das Crest der Freundschaft trägt. Seine französisch-japanische Abstammung zeigt sich in seinem hellen Teint, blonden Haaren und blauen Augen. Die Scheidung seiner Eltern in seiner Kindheit führte dazu, dass er bei seinem Vater in Odaiba lebte, während sein jüngerer Bruder Takeru "T.K." Takaishi bei ihrer Mutter wohnte. Diese Trennung prägte Yamato tief und führte zu einer beschützenden, manchmal überfürsorglichen Haltung gegenüber T.K. sowie zu einer Neigung zur Einsamkeit und Selbstzweifeln.
Anfangs kühl und verschlossen, entwickelte sich Yamato zu einem offeneren und unterstützenden Teammitglied. Seine Fürsorge erstreckte sich auf enge Freunde, obwohl er häufig mit Tai Kamiya aneinandergeriet, da ihre Führungsstile kontrastierten – Yamato bevorzugte sofortige Sicherheit über größere Risiken. In seiner Jugend entdeckte er seine Leidenschaft für Musik und gründete Bands wie Teen-age Wolves und später Knife of Day als Sänger und Bassist.
In *Digimon Adventure: Last Evolution Kizuna* ist Yamato ein Student im vierten Jahr der Ingenieurwissenschaften, der vor ungewisser Zukunft steht. Der Film enthüllt einen kritischen Konflikt: Mit zunehmendem Alter der DigiDestined schwächt sich ihre Bindung zu ihren Digimon-Partnern ab, visualisiert durch Countdown-Ringe auf ihren Digivices. Yamato und Tai entdecken, dass weitere Digivolutionen diesen Countdown beschleunigen und eine dauerhafte Trennung von Gabumon und Agumon droht.
Als Eosmon angreift, untersucht Yamato aktiv die Bedrohung. Er koordiniert mit der jüngeren Generation der DigiDestined, deckt Menoa Belluccis Manipulation auf und identifiziert die Beteiligung ihres Mitarbeiters Kyotaro Imura. Trotz des persönlichen Risikos entscheidet sich Yamato zu kämpfen und akzeptiert, dass der Einsatz von Gabumons Kraft ihre Trennung beschleunigt. Im finalen Kampf nimmt Gabumon eine neue "Bond of Friendship"-Form an, um Eosmon zu besiegen. Yamato verbringt die verbleibende Zeit mit Gabumon, bevor ihr Digivice zu Stein wird und ihre Partnerschaft endet.
Nach diesen Ereignissen schlug Yamato eine Karriere in der Luft- und Raumfahrt ein und wurde schließlich Astronaut. Er heiratete Sora Takenouchi, und sie haben zwei Kinder: eine Tochter, die mit Pyocomon verbunden ist, und einen Sohn, der mit Tunomon verbunden ist. Yamato und Gabumon erreichten den Meilenstein, das erste menschlich-Digimon-Paar zu sein, das auf dem Mars landete.
In späteren Auftritten wie dem *Digimon Adventure -Beyond-*-Segment besitzt Yamato einen internationalen Führerschein und hilft bei der Abwehr von Digimon-Bedrohungen zusammen mit Tai und Iori Hida. Sein pragmatischer Rat an Tai über Karrierefähigkeiten und ihre anhaltenden Kämpfe unterstreichen sein anhaltendes Engagement, beide Welten zu schützen.