Shirō Emiya, eine parallele Inkarnation aus Miyus Welt, steht als unerschütterlicher Beschützer seiner Pflegeschwester da. Bei einem stadtweiten Brand, der durch die Folgen des Vierten Heiligen Gral-Krieges ausgelöst wurde, verwaist, wurde er von Kiritsugu Emiya gerettet und in Magie ausgebildet, wobei er eine beispiellose Fertigkeit entwickelte – einschließlich präziser Aktivierung von Magikreisläufen –, die andere Versionen in den Schatten stellt. Nach Kiritsugus Tod widmet er sich dem Schutz Miyus und ergreift strenge Maßnahmen wie ein schützendes Bounded Field und Hausunterricht, um sie von äußeren Gefahren abzuschirmen. Sein Äußeres weist kastanienbraunes Haar mit weißen Strähnen und unregelmäßigen gebräunten Flecken auf, körperliche Merkmale, die auf langen Gebrauch der Archer-Class-Karte und den schleichenden Einfluss von EMIYA zurückzuführen sind. Die Aktivierung der Archer-Karte verändert seine Kleidung, sodass sie der von EMIYA gleicht, komplett mit einem roten Stirnband und einem ärmellosen rechten Arm – Verwandlungen, die nach Gebrauch verblassen, aber bleibende Spuren der Belastung hinterlassen. Getrieben von einem unerschütterlichen Gelübde, Miyu zu beschützen, lehnt er die Forderung der Ainsworths, sie für die Rettung der Menschheit zu opfern, trotzig ab. Diese Hingabe zeigt sich in täglichen Akten der Fürsorge: Bücher schenken, Lebensfertigkeiten vermitteln und wachsam ihr Wohlergehen sichern. Zerrissen zwischen Kiritsugus Ideal eines „Helden der Gerechtigkeit“ und der ethischen Last, ein Leben über das globale Überleben zu stellen, verhärtet sich seine Entschlossenheit nach Sakuras Tod – ein Verlust, der seine Entscheidung festigt, Miyu ungeachtet der Konsequenzen voranzustellen. Seine Dynamik mit Julian Ainsworth wandelt sich von lockerem Schulkameraden-Verhältnis zu bitterer Feindschaft, als ihre Ideologien über Miyus Schicksal kollidieren. Julians Inszenierung der Schattenkrise in Fuyuki und die Auslöschung von Miyus Abstammung treiben Shirō in einen direkten Konflikt mit den Ainsworths. Während des Fünften Heiligen Gral-Kriegs schließt er einen Vertrag mit Saber und kämpft, um Katastrophen abzuwenden, während er mit der Angst ringt, EMIYAs Rücksichtslosigkeit zu spiegeln. Seine Haltung schwankt zwischen sarkastischem Humor und schuldgetriebener Dringlichkeit, während die Opferzahlen steigen. Später von den Ainsworths gefangen genommen, um Miyu zu manipulieren, ermöglicht er ihre Flucht in eine andere Welt, bevor er selbst wieder in den Kampf eingreift. Gegnern wie Angelica Ainsworth mit verstärkten Waffen und Bogenkunst gegenüberstehend, erträgt er den zunehmenden Einfluss EMIYAs – erkennbar an flüchtiger Hautton-Umkehrung –, während Körper und Psyche zerbrechlich werden. Sein Bogen gipfelt in der Akzeptanz moralischer Grauzonen, als Symbol für den Preis, kosmische Maßstäbe für eine einzige kostbare Bindung zu missachten.