Makoto Kyogoku ist 184 cm groß und wiegt 79 kg. Dieser 18-Jährige perfektionierte seine außergewöhnlichen Kampfkunstfähigkeiten an der Haido High School, wo er als Kapitel des Karateteams fungierte und den Spitznamen "Der Prinz der Tritte" erhielt. Sein erstes Zusammentreffen mit Sonoko Suzuki ereignete sich, als sie ihre Freundin Ran Mouri bei einem Karateturnier anfeuerte, was sein Interesse weckte. Später trafen sie sich erneut im Familienpension seiner Familie in Izu, wo Sonoko mit Ran und Conan Edogawa Urlaub machte. Während dieses Aufenthalts schützte Makoto Sonoko vor einem Serienmörder, der sie aufgrund falscher Verdächtigungen ins Visier genommen hatte, und festigte so ihre Bindung, trotz seiner häufigen Abwesenheit aufgrund internationaler Karateturniere und Auslandsstudien. Ihre Fernbeziehung hält an, wobei Sonoko handgefertigte Geschenke schickt und Makoto loyal bleibt, obwohl seine Wettkampfverpflichtungen und seine Schüchternheit ihr gegenüber Herausforderungen darstellen.
Makoto verfügt über außergewöhnliche Kampffähigkeiten und hält eine internationale Siegesserie von 400 Kämpfen, die nur unterbrochen wurde, als er ein Turnier ausließ, um Sonokos Eltern zu treffen. Zu seinen Leistungen gehören das Fangen von BB-Pellets von 11 Angreifern bei eingeschränkter Sicht, das Entwaffnen von schwerttragenden Gangstern, das Zerschmettern von Waffen mit Tritten und das Stoppen eines fahrenden Lieferwagens durch Anheben des Heckteils. Er zeigt auch scharfe Beobachtungsgabe, indem er Kaitou Kid in Sonokos Verkleidung anhand winziger physiologischer Unterschiede wie Fingerlänge identifizierte.
Persönlich bleibt Makoto in Krisensituationen ruhig, wird aber im Zusammenhang mit Sonoko nervös. Er hat konservative Ansichten über ihre Kleidung und sorgt sich oft, dass sie sich "erkältet", wenn sie freizügige Kleidung trägt. Er trägt ständig ein Pflaster über seiner linken Augenbraue, das eine Narbe verbirgt; dies dient später als Talisman, als er ein Foto von Sonoko darunter platziert. Seine beschützende Natur geht über Sonoko hinaus, wie zu sehen war, als er den Selbstmordversuch eines Täters während eines Falls vereitelte, in dem er fälschlich beschuldigt wurde.
Im Fall "Der Understudy" sprang Makoto für einen verletzten Schauspieler während eines Filmdrehs ein, wurde jedoch zum Mordverdächtigen, als der Schauspieler zu Tode stürzte. Er reinigte seinen Namen, nachdem der wahre Täter, Hideka Aburai, entlarvt wurde, der den Tod durch einen Streich mit einem Insektenspielzeug inszeniert hatte. Makoto griff später ein, um Aburais Selbstmordversuch durch einen Lieferwagenabsturz zu verhindern, und arbeitete mit Ran zusammen, um das Fahrzeug aufzuhalten.
Makoto wurde der Suzuki-Familie offiziell vorgestellt, die ihn akzeptierte. Er unterstützt sie in Sicherheitsfragen, insbesondere während Kaitou Kids Juwelendiebstählen. Meilensteine seiner Beziehung sind das Missverständnis von Sonokos handgefertigter Töpferei als Vase, sein Sturm durch einen Schneesturm aus Eifersucht wegen Valentins-Schokolade (die sie für ihn bestimmt hatte) und das Zelten in einem Wald, um ihre Treffanweisungen zu entschlüsseln. Episode One: The Great Detective Turned Small zeigt Makoto Kyogoku nicht.