Shinichi Kudo ist ein 16-jähriger Highschool-Detektiv, der als „Heisei Holmes“ und „Retter der Polizei“ gefeiert wird, weil er komplexe Fälle löst, die über die Fähigkeiten der Strafverfolgungsbehörden hinausgehen. Als Sohn des Mystery-Autors Yusaku Kudo und der ehemaligen Schauspielerin Yukiko Kudo wurde er bereits in seiner Kindheit durch seinen Vater mit Tatorten konfrontiert, was seine Ermittlungsinstinkte schärfte und ihn gegenüber Gewalt abstumpfte. Ein entscheidendes Ereignis ereignete sich im Kindergarten, als er die Entführung von Ran Mouri verhinderte und damit ihre lebenslange Bindung besiegelte. Während er Rans Karate-Meisterschaftssieg im Tropical Land feierte, beobachtete Shinichi eine verdächtige Transaktion zwischen zwei Männern in Schwarz. Als er allein ermittelte, wurde er von Gin, einem hochrangigen Mitglied der geheimnisvollen Black Organization, überfallen. Gin verabreichte ihm gewaltsam das experimentelle Gift APTX 4869, um ihn zu beseitigen. Statt zum Tod zu führen, löste das Gift eine seltene Nebenwirkung aus, die seinen Körper auf das eines Sechs- oder Siebenjährigen zurücksetzte. Um seine Identität zu verbergen und seine Lieben vor der Organisation zu schützen, nahm Shinichi das Pseudonym Conan Edogawa an, eine Kombination der Namen der Autoren Arthur Conan Doyle und Edogawa Rampo. Er zog bei Ran und ihrem Vater, dem Privatdetektiv Kogoro Mouri, ein. Indem er Kogoros Fälle als Deckung nutzte, verfolgte Conan heimlich Hinweise auf die Black Organization. Der befreundete Erfinder Professor Hiroshi Agasa stattete ihn mit Gadgets für seine Ermittlungen aus, darunter eine sprechverzerrende Krawatte, um Kogoro während Deduktionen zu imitieren. Shinichi besitzt hohe Intelligenz, scharfe Beobachtungsgabe und umfangreiches Wissen in Bereichen wie Forensik, Physik und Literatur, wobei er sich oft von Sherlock Holmes inspirieren lässt. Er gab eine vielversprechende Fußballkarriere auf, um sich auf Reflexe zu konzentrieren, die für die Detektivarbeit nützlich sind, obwohl er außergewöhnliche athletische Fähigkeiten, besonders im Fußball, beibehält. Anfangs arrogant, genoss er die Medienaufmerksamkeit und dramatischen Enthüllungen von Tätern. Seine erzwungene Verjüngung förderte seine Bescheidenheit und verlagerte seinen Fokus von Anerkennung auf Lebensrettung und gerechte Bestrafung ohne Verzweiflung. Seine Beziehung zu Ran entwickelte sich von einer Kindheitsfreundschaft zu gegenseitiger romantischer Zuneigung. Er versuchte, ihr seine Gefühle im Tropical Land zu gestehen, wurde aber unterbrochen. Spätere temporäre Rückverwandlungen ermöglichten ihm flüchtige Gelegenheiten, seine Gefühle auszudrücken, die in einem erfolgreichen Geständnis während der London-Arc gipfelten. Rans wiederholte Warnung, dass die Detektivarbeit ihn in Gefahr bringen könnte, bleibt ein wiederkehrendes Motiv, an das er sich nach seiner Verwandlung erinnert. Als Conan gründete er mit seinen Klassenkameraden Ayumi Yoshida, Mitsuhiko Tsuburaya und Genta Kojima die Detektivjugend, ursprünglich als Tarnung, doch entwickelte sich echte Kameradschaft. Die Gruppe wurde später um Ai Haibara erweitert, die sich als Shiho Miyano (die Wissenschaftlerin mit dem Codenamen Sherry, die APTX 4869 entwickelte) entpuppte und ebenfalls nach ihrer Flucht aus der Black Organization in die Kindheit zurückversetzt wurde. Ihr wissenschaftliches Fachwissen erwies sich als entscheidend für die Entwicklung temporärer Gegenmittel. Shinichi pflegt ein Netzwerk von Verbündeten, darunter der Rivale Heiji Hattori, der seine wahre Identität aufdeckte, und der FBI-Agent Shuichi Akai. Trotz seiner Kinderform löst er weiterhin Fälle rund um die Black Organization, nutzt Agasas Erfindungen und temporäre Gegenmittel, um intermittierend seine Originalidentität wiederherzustellen. Seine Hauptziele bleiben die Aufdeckung der Organisation, die Sicherung eines permanenten Gegenmittels und die Rückkehr zu seinem Leben als Shinichi Kudo.