Last Order, bezeichnet als Misaka 20001, ist der ultimative Klon des Level 6 Shift-Projekts und fungiert als zentrale Befehlsstelle und Fail-Safe-Administratorin des Misaka-Netzwerks. Ihr körperliches Wachstum wurde bewusst in einem kindlichen Zustand eingefroren, der einer 10-jährigen Mikoto Misaka ähnelt, gekennzeichnet durch eine markante Ahoge, rosa Wangenmarkierungen und Augen, die Mikotos Originalfarbe widerspiegeln – im Gegensatz zu ihren Klon-Schwestern. Anfangs in zerlumpte Tücher gehüllt, trägt sie später ein lebhaftes blau gepunktetes Kleid, einen weißen Mantel und Sandalen. Emotional lebendiger als ihre zurückhaltenden Gegenstücke, strahlt Last Order verspielte Neugier aus, kommuniziert in der dritten Person mit doppelten "Misaka"-Verweisen und knüpft tiefe Bindungen zu Accelerator, Yomikawa Aiho, Yoshikawa Kikyou und Misaka 10032. Obwohl sie die kollektiven Erinnerungen aller Klone, einschließlich derer, die von Accelerator getötet wurden, in sich trägt, erkennt sie seine widerwillige Teilnahme an den Experimenten und spricht ihm die Schuld ab. Ihr scharfer Instinkt entschlüsselt Accelerators verborgene Absichten und Touma Kamijous entscheidende Rolle beim Stoppen des Projekts. Trotz Gefahr greift sie selbstlos ein, um Fräulein Kreutune zu retten, und zeigt unerschütterliche Empathie. Vorzeitig nach dem Ende des Projekts erwacht, debütiert sie physisch im Three Stories Arc, geschwächt und zusammenbrechend, bevor sie während der Academy City Invasion zum Spielball in Kihara Amatas Virus-Plot wird. Accelerators opferbereites Eingreifen beseitigt die Malware, zementiert ihre schützende Bindung und katalysiert seine Erlösung. Mit Yomikawa und Yoshikawa zieht sie um und balanciert Alltagsleben mit Netzwerkpflichten. Ihr Handlungsspielraum erweitert sich in späteren Arcs: Im Battle Royale Arc arbeitet sie mit Uiharu Kazari zusammen, um Accelerator zu verfolgen, und nutzt elektromagnetische Wahrnehmung, um im urbanen Chaos zu navigieren. Im Necromancer Arc wird sie von Disciplinary Action (DA) ins Visier genommen und löst Accelerators defensive Wut aus. Als Netzwerkkern vereitelt sie Viren, manipuliert Datenströme und bleibt ein begehrtes Ziel für Gegner. Ihre Level 3 Radio Noise-Fähigkeiten übertreffen die elektrische Leistung standardmäßiger Klone, gepaart mit technokinetischem Hacking. Netzwerkzugang ermöglicht ihr, Phänomene zu erzeugen, Accelerators netzwerkabhängige Kräfte zu unterbrechen und gemeinsame Klon-Erinnerungen abzurufen. Trotz jugendlicher Erscheinung ist ihr taktischer Einfluss entscheidend in wissenschaftlichen und übernatürlichen Konflikten. Von Zerbrechlichkeit zu proaktiver Kraft gereift, prägt Last Order Accelerators Identität neu und fordert sein selbst zugeschriebenes Böse heraus. Im Tree Diagram Remnant Arc drängt sie ihn, die Klone zu schützen, wesentlich für seine moralische Wiedergeburt. Ihre Fähigkeit, Aggressoren wie Kreutune zu vergeben und einzelne Leben zu priorisieren, offenbart Reife jenseits ihrer Form und macht sie zum ethischen Grundpfeiler in Academy Citys moralischen Grauzonen.