Jin Shirato fungiert als taktischer Berater und Hacker von Strega und gehört zu einem Trio von abtrünnigen Persona-Nutzern, die sich SEES widersetzen. Als Überlebender der Experimente der Kirijo-Gruppe erlebte er erzwungene Persona-Erweckungen zusammen mit anderen Straßenkindern, die als Testsubjekte in Tartarus eingesetzt wurden. Nur Jin, Takaya Sakaki und Chidori Yoshino überlebten diese Qual, am Leben gehalten durch experimentelle Drogen, die verhinderten, dass ihre Kräfte sie töteten. Dieses Trauma festigte Jins absolute Abhängigkeit von Takaya, dem er zuschreibt, ihn vor der Verzweiflung gerettet zu haben. Folglich widmet Jin seine Existenz der Verwirklichung von Takayas Zielen, den er als Architekten seiner Freiheit betrachtet. In *Persona 3 the Movie #3: Falling Down* planen Jin und Takaya in ihrem Dark-Hour-Versteck. Jin äußert Bedenken über Chidoris Gefangennahme durch SEES und drängt auf eine sofortige Rettung. Takaya weist ihn zurück und argumentiert, Chidoris Gefangenschaft liege allein am Verlust ihres Evokers und dass unüberlegtes Handeln SEES begünstigen würde. Jin akzeptiert widerwillig die Vorsicht und verkörpert damit seine Rolle als rationales Gegengewicht zu Takayas Leichtsinn. Ihr Fokus verlagert sich auf die Vollmond-Operation, bei der Takaya einen Prototyp-Evoker der Kirijo-Gruppe enthüllt. Jin zeigt tiefes Unbehagen, was Stregas traumatische Verbindung zu solchen Geräten widerspiegelt. Takaya erklärt, Evoker entfalten die volle Persona-Kraft auf Kosten der Kontrolle – besonders für künstlich erweckte Nutzer wie sie – und bekräftigt seine eigene Weigerung, einen zu benutzen. Jins indirekter Einfluss prägt Chidoris Schicksal. Nachdem ihre Gefangenschaft sie an Junpei Iori bindet, konfrontiert Takaya die beiden in Tartarus und schießt auf Junpei wegen Chidoris vermeintlichen Verrats. Chidori opfert ihr Leben, um Junpei zu heilen, begleitet vom Insert-Song "Storm for a Butterfly". Obwohl physisch abwesend, impliziert Jins frühere Zustimmung, Chidori aufzugeben, seine Mitschuld an ihrem Tod. Jins letztes Gefecht findet auf der 258. Ebene von Tartarus statt. Von Takaya isoliert und von Shadows belagert, kämpft er allein gegen SEES, um Takayas Pläne zu schützen. Nach seiner Niederlage enthüllt er SEES die Ursprünge von Strega, lehnt jedoch ihre Hilfe ab. Er wählt den Tod auf seine eigenen Bedingungen, zündet eine Granate, tötet sich selbst, während er Shadows abwehrt, und bekräftigt seine Loyalität zu Takayas Idealen – ein Zeugnis seiner unbeugsamen Treue und seiner unerfüllten Suche nach Freiheit. Im Kampf setzt Jin Granaten und Sprengstoffe ein, begleitet von seiner Hermit-Arkana-Persona Moros, die über Feuer-, Dunkelheits- und Debuff-Fähigkeiten verfügt. Die Hermit-Arkana symbolisiert seine Blindheit gegenüber seiner eigenen Unterwürfigkeit und seinem verbogenen Weg. Sein taktisches Geschick zeigt sich in der Verwaltung des "Revenge Request"-Attentatsorts und der Planung von Strategien gegen SEES, obwohl er oft unbeabsichtigt kritische Informationen preisgibt. Er hegt tiefen Hass auf SEES, insbesondere auf Mitsuru Kirijo – die er spöttisch als "kleine Dame" bezeichnet –, da er sie als Heuchler sieht, die ihre natürlichen Persona-Gaben verschwenden.