Mitsuru Kirijo, alleinige Erbin des mächtigen Kirijo Group-Konglomerats, ist die Schülerratspräsidentin der Gekkoukan High School. Sie gründete das Specialized Extracurricular Execution Squad (SEES), um übernatürliche Shadows zu bekämpfen. Ihre Familiengeschichte ist eng mit der Dark Hour verflochten, einer verborgenen Zeit zwischen den Tagen, in der Shadows auftauchen. Ihr Großvater, Kouetsu Kirijo, initiierte Experimente, die versehentlich die Dark Hour und die Shadows erschufen, während er ein Zeitmanipulationsgerät entwickelte, wobei Yukari Takebas Vater, Eiichiro Takeba, beteiligt war. Während der Juli-Vollmond-Ereignisse in *Midsummer Knight's Dream* führt Mitsuru SEES gegen Shadows, darunter die Arcana Hierophant und Lovers. Auf einem Sommerausflug nach Yakushima enthüllt ihr Vater, Takeharu Kirijo, die ganze Wahrheit über die Rolle der Kirijo Group bei der Entstehung der Dark Hour und der Shadows, was Yukari stark belastet. Mitsuru unterstützt ihre Teammitglieder während dieser Enthüllung. Später überwacht sie die Aufnahme neuer SEES-Mitglieder: Ken Amada, ein Grundschüler, der sein Persona erwacht, nachdem er Shadows gesehen hat, die dem Mörder seiner Mutter ähneln, und Koromaru, ein Hund, der ebenfalls ein Persona erwacht. Mitsuru übernimmt die taktische Führung gegen die antagonistische Gruppe Strega und koordiniert SEES während Konfrontationen wie Kämpfen gegen kombinierte Shadow Arcanas Chariot und Justice, wobei sie sich auf Verbündete wie Shinjiro Aragaki verlässt. Als Shinjiros Vergangenheit, die mit dem versehentlichen Tod von Kens Mutter verbunden ist, ans Licht kommt, offenbaren Mitsuru und Akihiko Sanada dies SEES. Shinjiros anschließendes Opfer, um Ken vor Strega-Anführer Takaya Sakaki zu schützen, hat tiefgreifende Auswirkungen auf die Gruppe. Ihre Persönlichkeit vereint aristokratische Gelassenheit mit sozialer Unerfahrenheit. In Privilegien aufgewachsen, fehlt ihr die Erfahrung mit alltäglichen Aktivitäten und Lebensmitteln wie Hamburgern oder Ramen. Formellität prägt ihre anfänglichen Interaktionen; sie spricht die meisten SEES-Mitglieder mit Nachnamen an, behält Vornamen engen Vertrauten wie Akihiko Sanada vor, den sie seit der Mittelschule kennt. Trotz ihrer gefassten Fassade zeigt sie gelegentliche soziale Unbeholfenheit und Unbehagen in lockeren Situationen, reagiert schüchtern auf Komplimente oder ungewohnte Szenarien. Ihre Führung betont akademische Exzellenz und Disziplin, indem sie SEES-Mitglieder ohne vorherige Absprache in Sommerkurse einschreibt. Im Kampf führt Mitsuru einen Rapier und beherrscht eis-elementare Magie durch ihr Persona, Penthesilea. Nachdem Fuuka Yamagishi SEES beitritt, wechselt Mitsuru von der Unterstützungs- zur Frontkämpferrolle und nutzt Fukuas Persona für taktische Analysen. Sie ist schwach gegen feuerbasierte Angriffe. Ihr Charakter entwickelt sich in anderen *Persona 3*-Medien weiter. Sie verliert ihren Vater durch Shuji Ikutsukis Verrat, was zunächst ihren Willen zerbricht. Mit Yukaris Unterstützung findet sie ihren Zweck wieder und übernimmt schließlich nach der High School die Leitung der Kirijo Group. In Spin-offs wie *Persona 4 Arena*, das zwei Jahre später spielt, gründet Mitsuru die Shadow Operatives Task Force, um Shadow-Vorfälle zu untersuchen, und erscheint als Universitätsstudentin, die ihr entwickeltes Persona, Artemisia, führt. Weitere Auftritte umfassen Rhythmusspiele (*Persona 3: Dancing in Moonlight*) und Crossover-Titel (*BlazBlue: Cross Tag Battle*), in denen sie ihre Kampffähigkeiten und aristokratische Haltung beibehält.